More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1525 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  100 
 
 
215 aa  443  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  49.5 
 
 
217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  50.74 
 
 
217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  46.5 
 
 
219 aa  192  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  47.29 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.85 
 
 
215 aa  184  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  45.67 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  47.78 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  45.05 
 
 
212 aa  181  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  43.98 
 
 
232 aa  180  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.24 
 
 
216 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  44.02 
 
 
223 aa  178  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  46 
 
 
223 aa  177  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  44.39 
 
 
220 aa  177  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  45.81 
 
 
213 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.32 
 
 
213 aa  176  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  44.34 
 
 
215 aa  176  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  50.28 
 
 
217 aa  176  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  46.99 
 
 
213 aa  175  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  44.15 
 
 
232 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  44.06 
 
 
212 aa  174  8e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  45.24 
 
 
229 aa  174  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  42.93 
 
 
212 aa  174  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  43.87 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  37.09 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  44.39 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  42.93 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  43.81 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.02 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  46.37 
 
 
216 aa  171  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  43.37 
 
 
241 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  45.32 
 
 
213 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  44.75 
 
 
214 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.93 
 
 
217 aa  169  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  44.02 
 
 
220 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  46.86 
 
 
221 aa  169  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.81 
 
 
220 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  42.72 
 
 
216 aa  167  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  44 
 
 
221 aa  167  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  40 
 
 
225 aa  167  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  41.67 
 
 
215 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  40.2 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  44 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  46.32 
 
 
215 aa  165  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  42.11 
 
 
215 aa  165  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  42.33 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  42.16 
 
 
213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  41.88 
 
 
213 aa  164  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  43.93 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  40.67 
 
 
228 aa  162  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.06 
 
 
225 aa  161  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  37.68 
 
 
261 aa  160  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  43.46 
 
 
217 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  46.15 
 
 
215 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  40.39 
 
 
225 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  45.78 
 
 
217 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  41.87 
 
 
226 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  45.78 
 
 
217 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  40.95 
 
 
225 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  38.54 
 
 
221 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.29 
 
 
210 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  46.33 
 
 
213 aa  159  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.38 
 
 
212 aa  158  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  40 
 
 
212 aa  158  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  39.51 
 
 
212 aa  158  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.36 
 
 
213 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  44.51 
 
 
217 aa  157  8e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  42.54 
 
 
212 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  41.49 
 
 
212 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  38.76 
 
 
217 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  39.6 
 
 
223 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  45.18 
 
 
217 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  43.6 
 
 
211 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  38.54 
 
 
212 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  38.61 
 
 
224 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  40.96 
 
 
212 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  39.17 
 
 
240 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  41.23 
 
 
256 aa  156  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.78 
 
 
224 aa  155  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  39.51 
 
 
212 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  38.54 
 
 
212 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  41.28 
 
 
211 aa  155  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  39.51 
 
 
213 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  39.51 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  39.51 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  43.09 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  37.86 
 
 
224 aa  154  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  39.89 
 
 
212 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  39.27 
 
 
212 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  40.96 
 
 
213 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  38.54 
 
 
212 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  38.73 
 
 
217 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  38.54 
 
 
212 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  39.67 
 
 
211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  42.78 
 
 
215 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  37.56 
 
 
213 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  38.54 
 
 
212 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  39.67 
 
 
211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  39.89 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  37.89 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>