More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1079 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  100 
 
 
230 aa  471  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  71.74 
 
 
232 aa  363  1e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  79.62 
 
 
215 aa  361  5.0000000000000005e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  61.4 
 
 
215 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  61.4 
 
 
215 aa  288  6e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  61.36 
 
 
220 aa  287  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  58.22 
 
 
213 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  58.9 
 
 
223 aa  274  9e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  57.89 
 
 
212 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  57.28 
 
 
213 aa  272  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.81 
 
 
216 aa  272  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  56.48 
 
 
220 aa  270  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  57.21 
 
 
216 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  58.33 
 
 
226 aa  267  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.33 
 
 
225 aa  266  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  56.56 
 
 
221 aa  266  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  55.09 
 
 
225 aa  262  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  55.98 
 
 
212 aa  262  4e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  56.25 
 
 
215 aa  260  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  55.71 
 
 
215 aa  257  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.46 
 
 
224 aa  251  7e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  54.93 
 
 
217 aa  249  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  53.46 
 
 
224 aa  249  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  53.7 
 
 
217 aa  248  7e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  53.7 
 
 
217 aa  248  7e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  54.21 
 
 
217 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  52.78 
 
 
217 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  53.77 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  52.13 
 
 
224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  51.4 
 
 
215 aa  241  6e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  51.66 
 
 
221 aa  240  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  50.48 
 
 
225 aa  236  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  50.24 
 
 
225 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  50.24 
 
 
223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  52.38 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  49.53 
 
 
214 aa  210  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  48.61 
 
 
213 aa  206  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  48.61 
 
 
213 aa  204  9e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  48.82 
 
 
223 aa  203  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  49.54 
 
 
213 aa  202  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  52.55 
 
 
217 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  47.85 
 
 
213 aa  201  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  45.62 
 
 
214 aa  198  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  44.64 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  45.78 
 
 
226 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  48.1 
 
 
228 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  48.66 
 
 
232 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  45.71 
 
 
216 aa  191  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  46.19 
 
 
220 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  43.52 
 
 
230 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  44.76 
 
 
214 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  42.04 
 
 
240 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  45.77 
 
 
241 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  45.67 
 
 
215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  46.01 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  47.64 
 
 
212 aa  176  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.37 
 
 
212 aa  174  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  45.97 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.24 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  35.91 
 
 
234 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  41.71 
 
 
221 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  41.71 
 
 
221 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  44.95 
 
 
217 aa  166  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  44.25 
 
 
208 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.93 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  40.76 
 
 
221 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  50.86 
 
 
217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.89 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.99 
 
 
217 aa  162  6e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  45.98 
 
 
209 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  43.89 
 
 
209 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  43 
 
 
212 aa  158  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  45.4 
 
 
209 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  37.56 
 
 
213 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  42.54 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  41.71 
 
 
212 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  41.71 
 
 
212 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.142805 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  37.56 
 
 
261 aa  151  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  39.35 
 
 
256 aa  149  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  42.71 
 
 
212 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  44.5 
 
 
210 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  41.21 
 
 
212 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  41.58 
 
 
213 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  43.35 
 
 
212 aa  148  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  42.21 
 
 
212 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  44.31 
 
 
217 aa  148  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  40.7 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  40.7 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  43.93 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  40.62 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  44.25 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  41.71 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.71 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.71 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  36.24 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  43.27 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  41.71 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.71 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  41.71 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  40.7 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>