More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0075 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0075  1-Cys peroxiredoxin  100 
 
 		 216 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4026  1-Cys peroxiredoxin  75.46 
 
 		 217 aa  340  7e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4088  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64.52 
 
 		 219 aa  290  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964314  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2756  peroxidase  64.52 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1639  Peroxidase  63.13 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.160571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1458  Peroxidase  62.21 
 
 		 219 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4963  peroxidase  61.75 
 
 		 219 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419029  hitchhiker  0.00950513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4841  peroxidase  58.72 
 
 		 219 aa  255  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  56.88 
 
 		 218 aa  254  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  55.05 
 
 		 217 aa  246  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  55.96 
 
 		 217 aa  244  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  55.05 
 
 		 218 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0482  peroxidase  55.96 
 
 		 220 aa  244  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  55.5 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3637  Peroxidase  54.13 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0335731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  54.88 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  52.07 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2758  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.29 
 
 		 220 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  53.24 
 
 		 212 aa  231  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4916  thioredoxin peroxidase (AhpC, Alkyl hydroperoxide reductase)  53.88 
 
 		 219 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0777  peroxidase  54.79 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.409644  normal  0.136883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2647  Peroxidase  52.51 
 
 		 220 aa  228  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  51.15 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0701  Peroxidase  49.77 
 
 		 211 aa  221  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0373807  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  49.77 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  49.77 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  50 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  50.23 
 
 		 211 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  51.39 
 
 		 256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  50.92 
 
 		 211 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  50.46 
 
 		 210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  50.23 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  50.95 
 
 		 213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2167  peroxidase  48.4 
 
 		 219 aa  214  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  50.23 
 
 		 213 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  49.77 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.49 
 
 		 219 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  48.17 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  50.47 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  50 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  48.17 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  50 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  46.33 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  46.33 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  47.25 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  47.25 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  47.25 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  48.39 
 
 		 211 aa  211  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  49.77 
 
 		 212 aa  211  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  47.03 
 
 		 212 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  47.69 
 
 		 208 aa  211  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  46.58 
 
 		 212 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  49.31 
 
 		 217 aa  211  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  49.3 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  48.85 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  50.47 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  46.79 
 
 		 212 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  48.39 
 
 		 213 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  49.54 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  48.17 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  50 
 
 		 261 aa  208  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  46.79 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  46.33 
 
 		 212 aa  207  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2859  Peroxidase  48.4 
 
 		 212 aa  207  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  46.79 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  46.33 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  46.33 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  46.79 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  45.66 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  48.62 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  45.41 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  45.16 
 
 		 213 aa  204  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  46.33 
 
 		 212 aa  204  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  45.41 
 
 		 212 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  45.41 
 
 		 212 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  46.33 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  46.33 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.33 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.33 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  46.33 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  46.33 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.33 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.33 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  49.31 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  46.33 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.87 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2374  1-Cys peroxiredoxin  47.93 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0121  1-Cys peroxiredoxin  46.54 
 
 		 214 aa  201  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  hitchhiker  0.000177221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  44.04 
 
 		 212 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  45.66 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  44.95 
 
 		 212 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  47.47 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  44.95 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  47.71 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  46.79 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  45.79 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  45.16 
 
 		 212 aa  194  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  45.41 
 
 		 212 aa  195  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00130  thioredoxin peroxidase, putative  46.32 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178013  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  46.08 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>