158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4393 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  78.47 
 
 		 562 aa  903    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  100 
 
 		 577 aa  1164    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  72.1 
 
 		 577 aa  820    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  49.56 
 
 		 998 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  49.11 
 
 		 998 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  49.12 
 
 		 991 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  40.55 
 
 		 615 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.13 
 
 		 612 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  32 
 
 		 610 aa  335  9e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  32 
 
 		 610 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  32 
 
 		 612 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32 
 
 		 610 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  31.96 
 
 		 612 aa  335  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  31.83 
 
 		 610 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  32.52 
 
 		 613 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  37.13 
 
 		 1153 aa  293  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  33.11 
 
 		 619 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  32.14 
 
 		 1148 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  30.99 
 
 		 618 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  33.51 
 
 		 617 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  35.25 
 
 		 589 aa  251  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  28.49 
 
 		 592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  28.49 
 
 		 592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  30.84 
 
 		 613 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  24.95 
 
 		 813 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  29.77 
 
 		 594 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  27.07 
 
 		 614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.39 
 
 		 604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  30.15 
 
 		 596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  28.03 
 
 		 599 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  29.46 
 
 		 635 aa  163  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  28.08 
 
 		 597 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  34.1 
 
 		 615 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  26.15 
 
 		 604 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  30.02 
 
 		 601 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  33.13 
 
 		 621 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  28.4 
 
 		 842 aa  159  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  28.71 
 
 		 596 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  26.99 
 
 		 614 aa  154  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  29.48 
 
 		 577 aa  153  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.99 
 
 		 614 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  25.31 
 
 		 819 aa  152  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.26 
 
 		 580 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  28.36 
 
 		 580 aa  150  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  26.24 
 
 		 625 aa  150  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  26.42 
 
 		 615 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  26.57 
 
 		 582 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  29.38 
 
 		 621 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  24.14 
 
 		 629 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  24.03 
 
 		 631 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  23.96 
 
 		 631 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  26.89 
 
 		 572 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  23.68 
 
 		 601 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  24.71 
 
 		 642 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  27.71 
 
 		 578 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  24.49 
 
 		 642 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.04 
 
 		 582 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.04 
 
 		 582 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  28.04 
 
 		 582 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  24.71 
 
 		 642 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  24.26 
 
 		 642 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  30.52 
 
 		 563 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  25.8 
 
 		 639 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  24.77 
 
 		 642 aa  139  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  25.74 
 
 		 608 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  27.71 
 
 		 799 aa  137  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  25.55 
 
 		 607 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  27.04 
 
 		 602 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  30.24 
 
 		 616 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  28.27 
 
 		 610 aa  108  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  24.95 
 
 		 633 aa  107  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  28.29 
 
 		 611 aa  103  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  32.91 
 
 		 716 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  26.75 
 
 		 578 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  26.75 
 
 		 578 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  24.52 
 
 		 588 aa  95.5  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  27.23 
 
 		 580 aa  94  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  26.02 
 
 		 580 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  30.25 
 
 		 578 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  29.57 
 
 		 584 aa  92.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.94 
 
 		 587 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  24.94 
 
 		 637 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  27.73 
 
 		 587 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  29.51 
 
 		 557 aa  87  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  30.54 
 
 		 588 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  24.85 
 
 		 585 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  24.85 
 
 		 585 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  27.59 
 
 		 608 aa  85.1  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  25.69 
 
 		 610 aa  84  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  27.68 
 
 		 592 aa  82.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  26.32 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  28 
 
 		 601 aa  81.6  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  23.95 
 
 		 655 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  27.58 
 
 		 595 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  21.59 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  23.17 
 
 		 655 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  26.03 
 
 		 609 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  25.57 
 
 		 925 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  27.02 
 
 		 591 aa  78.2  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  28.83 
 
 		 645 aa  78.2  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>