More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1514 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  100 
 
 		 543 aa  1116    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  47.58 
 
 		 526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  47.47 
 
 		 513 aa  465  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  38.16 
 
 		 538 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  36.57 
 
 		 520 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  35.99 
 
 		 518 aa  300  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0017  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  34.43 
 
 		 499 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  37.96 
 
 		 536 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  37.96 
 
 		 536 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  38.35 
 
 		 506 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  37.96 
 
 		 536 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  37.84 
 
 		 594 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  37.96 
 
 		 536 aa  293  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  37.96 
 
 		 536 aa  293  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  37.96 
 
 		 536 aa  293  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  37.75 
 
 		 544 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  36.16 
 
 		 517 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  35.17 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  34.6 
 
 		 510 aa  256  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  29.96 
 
 		 616 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  34.46 
 
 		 569 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  34.37 
 
 		 570 aa  177  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5434  type II secretion system protein E  28.12 
 
 		 609 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  32.9 
 
 		 569 aa  175  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0629  type II secretion system protein E  29.96 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5028  type II secretion system protein E  28.12 
 
 		 609 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  33.61 
 
 		 594 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  35.15 
 
 		 558 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  31.78 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 787 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  33.16 
 
 		 591 aa  168  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  34.78 
 
 		 558 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  33.98 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  32.29 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.05 
 
 		 577 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0585  type II secretion system protein E  33.08 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  32.58 
 
 		 577 aa  167  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  32.73 
 
 		 499 aa  167  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  34.05 
 
 		 493 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  34.05 
 
 		 493 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  34.05 
 
 		 493 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  32.96 
 
 		 587 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  34.71 
 
 		 507 aa  166  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  34.38 
 
 		 559 aa  166  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  34.05 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  34.48 
 
 		 497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  35.51 
 
 		 567 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  34.05 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  34.05 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  33.33 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  34.48 
 
 		 497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  31.2 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  33.24 
 
 		 571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  34.3 
 
 		 497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  34.3 
 
 		 497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  33.08 
 
 		 511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  31.54 
 
 		 583 aa  163  6e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  34.04 
 
 		 497 aa  163  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  31.71 
 
 		 885 aa  163  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  30.87 
 
 		 585 aa  163  7e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  31.36 
 
 		 871 aa  163  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  32.52 
 
 		 579 aa  163  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  31.28 
 
 		 546 aa  163  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  33.24 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  33.75 
 
 		 523 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 566 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  31.11 
 
 		 888 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.52 
 
 		 578 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  34.87 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  30.69 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  34.87 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  34.58 
 
 		 594 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  33.42 
 
 		 524 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  35.26 
 
 		 517 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  34.17 
 
 		 494 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  34.37 
 
 		 637 aa  161  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  32.19 
 
 		 467 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  33.17 
 
 		 514 aa  161  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  33.43 
 
 		 576 aa  160  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  33.5 
 
 		 613 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  33 
 
 		 514 aa  161  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  32.55 
 
 		 578 aa  160  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  33.15 
 
 		 595 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  33.88 
 
 		 568 aa  160  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  34.48 
 
 		 498 aa  160  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  32.83 
 
 		 521 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  31.35 
 
 		 544 aa  160  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  32.83 
 
 		 521 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  34.38 
 
 		 515 aa  160  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  32.83 
 
 		 521 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  32.83 
 
 		 521 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  34.22 
 
 		 595 aa  159  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  30.58 
 
 		 603 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  32.32 
 
 		 520 aa  159  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  33.89 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  32.88 
 
 		 595 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  29.82 
 
 		 570 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  33.33 
 
 		 521 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.38 
 
 		 577 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>