More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0008 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  100 
 
 		 324 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 352 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 347 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  31.51 
 
 		 288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  32.69 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 324 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  28.29 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  25.48 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 261 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  28.26 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 791 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  29.75 
 
 		 791 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.15 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 791 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.4 
 
 		 385 aa  109  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 844 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  25.48 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  27.6 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 777 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  29.21 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  27.65 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  25.23 
 
 		 340 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  25.73 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.62 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 317 aa  95.9  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.91 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  25.91 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.91 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.91 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.91 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.55 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.46 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 328 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 389 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>