More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2291 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  100 
 
 		 354 aa  739    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  81.3 
 
 		 358 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  78.59 
 
 		 363 aa  604  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  78.12 
 
 		 358 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  45.38 
 
 		 347 aa  322  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  44.96 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  44.96 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  44.09 
 
 		 347 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  44.38 
 
 		 347 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  43.93 
 
 		 347 aa  315  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  45.09 
 
 		 345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  43.75 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  44.67 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  45.66 
 
 		 345 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  44.35 
 
 		 346 aa  308  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  41.74 
 
 		 345 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  42.15 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  42.15 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  44.48 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  40.87 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  39.53 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  26.87 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.2 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30.75 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  28.22 
 
 		 372 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  27.75 
 
 		 376 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  29.45 
 
 		 354 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  31.63 
 
 		 363 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  29.74 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  29.74 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  29.95 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  29.89 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  27.52 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.3 
 
 		 362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  28.28 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  27.46 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  27.92 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  24.93 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  29.92 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.92 
 
 		 371 aa  106  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  27.69 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  30.27 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  29.41 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  27.43 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  28.31 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  33.9 
 
 		 353 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  24.85 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  32.34 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  28.15 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  33.51 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  32.4 
 
 		 380 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  35.52 
 
 		 439 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 336 aa  99.4  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  26.65 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  28.81 
 
 		 333 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  31.98 
 
 		 341 aa  97.1  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.53 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  26.26 
 
 		 383 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  33.73 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  34.43 
 
 		 436 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  26.8 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  26.21 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  34.43 
 
 		 436 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  34.43 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  27.14 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  34.43 
 
 		 436 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  24.43 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.18 
 
 		 342 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  27.73 
 
 		 334 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.71 
 
 		 329 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  34.74 
 
 		 292 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  28.4 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  32.8 
 
 		 324 aa  89.7  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  24.16 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  25 
 
 		 311 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  23.28 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  32.95 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  28.77 
 
 		 308 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  26.95 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  24.02 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  28.96 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  24.78 
 
 		 384 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  27.62 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  25.57 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.73 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1465  luciferase family protein  33.33 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  26.17 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  26.27 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  24.78 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  28.34 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  32.4 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  24.78 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  32.4 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.03 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  25.56 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  23.99 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  24.62 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>