More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2817 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  845    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  96.01 
 
 		 426 aa  815    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  59.86 
 
 		 441 aa  484  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 440 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  56.95 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  57.51 
 
 		 443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  57.58 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  59.81 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  58.29 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  58.29 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  58.29 
 
 		 441 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  58.29 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  58.29 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  58.29 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  59.71 
 
 		 442 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 447 aa  279  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 452 aa  269  8.999999999999999e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 434 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 416 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 413 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 443 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 440 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 444 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 438 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 426 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 448 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 426 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.43 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 465 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 439 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 439 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.95 
 
 		 448 aa  103  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  26.88 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  23.75 
 
 		 475 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 416 aa  100  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 432 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 432 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 432 aa  99.8  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  26.06 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  26.06 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  25.75 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  26.06 
 
 		 432 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  26.61 
 
 		 433 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 451 aa  97.1  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 440 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 506 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 412 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  22.33 
 
 		 432 aa  94  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 421 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 432 aa  93.2  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  23.27 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>