137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0360 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  75.98 
 
 		 272 aa  344  8e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  63.86 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  55.02 
 
 		 273 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  53.23 
 
 		 272 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  52.73 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  53.82 
 
 		 273 aa  228  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  54.22 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  49.21 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  52.12 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  49.6 
 
 		 273 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  48.12 
 
 		 331 aa  195  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  51.45 
 
 		 272 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  51.01 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  52.54 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  50 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  47.83 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  38.91 
 
 		 267 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  41.73 
 
 		 268 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  40.47 
 
 		 268 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  40.48 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  40.48 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  39.76 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  37.94 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  40.48 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  40.47 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  41.5 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  42.06 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  40.96 
 
 		 268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  40.96 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  40.96 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  40.32 
 
 		 268 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  38.34 
 
 		 266 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  39.27 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  31.35 
 
 		 290 aa  96.3  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  31.67 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  30.32 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  28.33 
 
 		 2798 aa  73.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  28.88 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  26 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  30.1 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  30.1 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  24.3 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  25.11 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  29.83 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  29.83 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  29.83 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  27.62 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  30.74 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  30.13 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  28.29 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  28.29 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  26.42 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  26.56 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  28.65 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  30.43 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  25.77 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  26.67 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  26.69 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  26.04 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  28.98 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  27.17 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  24.07 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  28.05 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  26.22 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.39 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  34.78 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  29.46 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  25.88 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  24.75 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  22.36 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  27.93 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  26.97 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  30.4 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  27.65 
 
 		 310 aa  48.9  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  23.17 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3912  hypothetical protein  27.09 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0103404  normal  0.04978 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  23.05 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  23.85 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  26.44 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  28.09 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  25.81 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  30.19 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  25.38 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  22.76 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  33.91 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1197  hypothetical protein  23.94 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  23.35 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  23.62 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  24.8 
 
 		 291 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0509  hypothetical protein  32.57 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  24.8 
 
 		 291 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1253  hypothetical protein  31.78 
 
 		 307 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0309797  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  24.91 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  27.45 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  29.2 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  22.46 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  27.98 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>