More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2436 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 517 aa  1030    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2698  hypothetical protein  71.4 
 
 		 523 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1426  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.61 
 
 		 514 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.2 
 
 		 486 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1984  hypothetical protein  57.98 
 
 		 487 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1821  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.92 
 
 		 524 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4950  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.24 
 
 		 525 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433467 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1220  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.98 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2588  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.22 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1982  hypothetical protein  47.76 
 
 		 510 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2854  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.58 
 
 		 548 aa  306  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.212974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.19 
 
 		 529 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  44.79 
 
 		 526 aa  294  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  44.08 
 
 		 535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.81 
 
 		 531 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.29 
 
 		 531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  41.81 
 
 		 531 aa  266  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  43.84 
 
 		 531 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  43.84 
 
 		 531 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  43.84 
 
 		 531 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  43.84 
 
 		 531 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  43.84 
 
 		 531 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  43.84 
 
 		 531 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  43.84 
 
 		 531 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.14 
 
 		 514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  39.66 
 
 		 533 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  42.23 
 
 		 514 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.23 
 
 		 514 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  43.35 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  38.87 
 
 		 522 aa  251  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  43.2 
 
 		 531 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.59 
 
 		 514 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.94 
 
 		 514 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  38.28 
 
 		 506 aa  239  9e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.93 
 
 		 530 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  40.47 
 
 		 482 aa  230  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.67 
 
 		 513 aa  225  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  40.61 
 
 		 487 aa  223  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.75 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  35.24 
 
 		 514 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  34.85 
 
 		 514 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  34.85 
 
 		 514 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  35.24 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  35.24 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.57 
 
 		 510 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  34.89 
 
 		 515 aa  206  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.7 
 
 		 515 aa  205  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  34.7 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  35.16 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  35.21 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  34.83 
 
 		 515 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  34.83 
 
 		 515 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  34.7 
 
 		 510 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.48 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  35.93 
 
 		 513 aa  199  9e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.87 
 
 		 490 aa  199  9e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 		 499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  31.59 
 
 		 504 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.89 
 
 		 499 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  31.4 
 
 		 504 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  34.25 
 
 		 508 aa  194  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  34.77 
 
 		 488 aa  194  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  31.59 
 
 		 504 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  34.96 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  33.84 
 
 		 503 aa  192  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  31.47 
 
 		 498 aa  192  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  34.4 
 
 		 462 aa  191  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  33.27 
 
 		 510 aa  191  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  34.12 
 
 		 496 aa  191  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.56 
 
 		 510 aa  187  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  32.96 
 
 		 514 aa  186  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.08 
 
 		 492 aa  186  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 		 494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.06 
 
 		 490 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.96 
 
 		 524 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.12 
 
 		 504 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  31.84 
 
 		 512 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.68 
 
 		 494 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.81 
 
 		 494 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  33.86 
 
 		 512 aa  179  8e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  32.46 
 
 		 513 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.81 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.17 
 
 		 513 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  36.58 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.4 
 
 		 528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.17 
 
 		 500 aa  174  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  32.7 
 
 		 499 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.11 
 
 		 530 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.9 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  35.82 
 
 		 436 aa  171  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.21 
 
 		 479 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.95 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  35.84 
 
 		 502 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  33.14 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  34.5 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.71 
 
 		 509 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32 
 
 		 527 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.63 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.95 
 
 		 519 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.15 
 
 		 492 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>