More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2030 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2030  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  677    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.556518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1232  hypothetical protein  64.36 
 
 		 332 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0281455  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4361  hypothetical protein  62.25 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3439  hypothetical protein  48.91 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0617  hypothetical protein  47.89 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4122  hypothetical protein  43.73 
 
 		 327 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3699  hypothetical protein  45.33 
 
 		 345 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286748  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0356  hypothetical protein  42.52 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3148  hypothetical protein  42.73 
 
 		 336 aa  275  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.96 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.8 
 
 		 327 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  35.91 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.5 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  36.76 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  35.8 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.18 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  38.11 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  36.42 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  36.63 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.62 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  35.67 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  33.65 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  33.13 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  36.75 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.45 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.86 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  33.23 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  35.64 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  36.31 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  35.64 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  36.91 
 
 		 342 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  33.13 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  34.58 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.03 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  35.89 
 
 		 334 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  33.84 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  35.56 
 
 		 328 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  34.65 
 
 		 326 aa  192  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  35.54 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  33.95 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.25 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  34 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  33.63 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  33.94 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.66 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  34.36 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  34.88 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  35.28 
 
 		 327 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  36.42 
 
 		 341 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0164  hypothetical protein  35.03 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  35.65 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  35.1 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0143  hypothetical protein  40 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  35.65 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  36.33 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  35.1 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  34.86 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  34.04 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  33.44 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  35.64 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  34.43 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  34.54 
 
 		 332 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  34.67 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  36.09 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  35.95 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  39.92 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  36.09 
 
 		 339 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  32.33 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  35.76 
 
 		 329 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  35.71 
 
 		 326 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  35.23 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  36.3 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  34.36 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  34.91 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  34.34 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  34.71 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  34.97 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6115  hypothetical protein  34.92 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  36.42 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  34.93 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  34.3 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  33.03 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  33.23 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  34.53 
 
 		 323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  32.32 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  33.67 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  33.9 
 
 		 333 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  33.22 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  34.25 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  36.58 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.62 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  34.13 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  35.8 
 
 		 322 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  32.93 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4556  hypothetical protein  33.43 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.912833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  34.05 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>