More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1694 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3270  CheA signal transduction histidine kinases  71.75 
 
 
712 aa  986    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.308158  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1694  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
715 aa  1450    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0385  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.88 
 
 
733 aa  300  6e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.222748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
604 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
603 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  35.59 
 
 
819 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  33.14 
 
 
928 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
783 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
760 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
607 aa  111  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3455  putative CheA signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 
795 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
1736 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
781 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
935 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  34.29 
 
 
766 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  35 
 
 
695 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
686 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  34.46 
 
 
870 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
728 aa  108  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
713 aa  108  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.94 
 
 
927 aa  108  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  39.55 
 
 
2458 aa  108  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
770 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4298  putative CheA signal transduction histidine kinases  24.26 
 
 
795 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  39.55 
 
 
2476 aa  108  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4068  putative CheA signal transduction histidine kinases  24.26 
 
 
795 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
865 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
865 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  35.98 
 
 
601 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.43 
 
 
942 aa  107  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  34.32 
 
 
610 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
921 aa  107  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  31.79 
 
 
916 aa  107  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
878 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
682 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3196  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
542 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
822 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3757  CheA signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 
794 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4834  putative CheA signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 
794 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0958  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
1286 aa  106  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.91 
 
 
1866 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
916 aa  106  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
635 aa  106  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
679 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
745 aa  105  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.24 
 
 
1960 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
989 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
989 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  34.29 
 
 
662 aa  104  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  31.21 
 
 
934 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  31.21 
 
 
922 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 
742 aa  104  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.29 
 
 
1971 aa  104  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1979  putative CheA signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 
793 aa  104  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
2212 aa  103  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  30.41 
 
 
769 aa  103  9e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  30.41 
 
 
769 aa  103  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  30.64 
 
 
927 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.82 
 
 
769 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
792 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
598 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
666 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  35.43 
 
 
1989 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
606 aa  103  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36 
 
 
1956 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
695 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.13 
 
 
803 aa  102  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3969  putative CheA signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 
796 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.191505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
2022 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
763 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
921 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.57 
 
 
1197 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
758 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2263  CheA signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
741 aa  102  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131466 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
679 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  34.88 
 
 
720 aa  101  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  32.54 
 
 
1010 aa  101  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  35.47 
 
 
769 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
759 aa  101  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  29.38 
 
 
1104 aa  101  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1771  CheA signal transduction histidine kinases  31.58 
 
 
727 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.91 
 
 
673 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
681 aa  100  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  33.52 
 
 
2070 aa  100  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
919 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  32.76 
 
 
674 aa  100  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
654 aa  100  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  30.64 
 
 
927 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 
677 aa  100  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
937 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.91 
 
 
681 aa  100  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
677 aa  100  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
911 aa  100  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
937 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
695 aa  100  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
814 aa  100  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
673 aa  100  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  32 
 
 
660 aa  99.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  35.06 
 
 
652 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
649 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>