More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0599 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0599  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
621 aa  1256    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0798741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  39.94 
 
 
588 aa  407  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  39.49 
 
 
551 aa  376  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  33.07 
 
 
631 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  32.17 
 
 
680 aa  319  7.999999999999999e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  31.96 
 
 
605 aa  316  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  31.93 
 
 
628 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  33.53 
 
 
665 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  32.79 
 
 
589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  31.61 
 
 
605 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  31.86 
 
 
610 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  30.5 
 
 
612 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  33.71 
 
 
559 aa  301  3e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  31.15 
 
 
586 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  32.05 
 
 
644 aa  293  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  31.07 
 
 
611 aa  292  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  31.42 
 
 
560 aa  291  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  31.14 
 
 
695 aa  291  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  33.39 
 
 
603 aa  291  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  31.61 
 
 
674 aa  291  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  33.28 
 
 
584 aa  291  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  31.96 
 
 
566 aa  290  6e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  30.85 
 
 
605 aa  289  9e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  31.29 
 
 
674 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  30.93 
 
 
629 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  30.19 
 
 
611 aa  287  4e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  29.73 
 
 
565 aa  287  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  30.77 
 
 
624 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  30.91 
 
 
608 aa  286  7e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  30.95 
 
 
692 aa  286  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  32.3 
 
 
621 aa  286  8e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  32.19 
 
 
614 aa  286  8e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  30.11 
 
 
600 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  30.53 
 
 
606 aa  286  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  32.42 
 
 
640 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  29.69 
 
 
641 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  31.87 
 
 
620 aa  283  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  29.57 
 
 
628 aa  281  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  29.34 
 
 
625 aa  280  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  31.09 
 
 
647 aa  280  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  30.24 
 
 
601 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  32.48 
 
 
606 aa  280  8e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  29.65 
 
 
600 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  31.6 
 
 
628 aa  279  1e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  30.89 
 
 
617 aa  278  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  30.11 
 
 
630 aa  278  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  32.34 
 
 
608 aa  277  4e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  28.55 
 
 
632 aa  277  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  30.35 
 
 
610 aa  276  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  30.29 
 
 
629 aa  276  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  31.55 
 
 
620 aa  276  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  30.12 
 
 
626 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  30.48 
 
 
630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  32.82 
 
 
656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  29.18 
 
 
644 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  31.61 
 
 
645 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  28.73 
 
 
617 aa  273  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  32.25 
 
 
659 aa  272  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  30.21 
 
 
589 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  31.11 
 
 
599 aa  272  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  31.2 
 
 
624 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  31.26 
 
 
633 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  27.93 
 
 
605 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  30.83 
 
 
639 aa  271  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  30.85 
 
 
633 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  29.54 
 
 
607 aa  270  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  44.82 
 
 
516 aa  269  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  30 
 
 
626 aa  269  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  28.91 
 
 
608 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  30.88 
 
 
622 aa  269  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  29.1 
 
 
643 aa  267  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  27.93 
 
 
602 aa  268  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  29.5 
 
 
644 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  30.15 
 
 
643 aa  267  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  27.69 
 
 
623 aa  267  5e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  27.69 
 
 
623 aa  267  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  28.91 
 
 
606 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  28.48 
 
 
622 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  29.03 
 
 
622 aa  266  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  30.17 
 
 
629 aa  266  8e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  29.58 
 
 
602 aa  266  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  28.75 
 
 
647 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  28.82 
 
 
621 aa  266  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  30.37 
 
 
632 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  30.05 
 
 
623 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  29.64 
 
 
621 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  30.37 
 
 
585 aa  265  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  30.53 
 
 
632 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  27.04 
 
 
691 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  29.29 
 
 
607 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  29.54 
 
 
594 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  30.22 
 
 
633 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  29.45 
 
 
619 aa  263  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  29.83 
 
 
682 aa  262  2e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  27.19 
 
 
626 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  30.43 
 
 
582 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  42.39 
 
 
516 aa  261  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0509  DNA mismatch repair protein  30.52 
 
 
598 aa  260  4e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.587743  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3464  DNA mismatch repair protein MutL  26.76 
 
 
692 aa  260  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  30.86 
 
 
623 aa  260  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>