More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1230 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1230  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
164 aa  340  5.999999999999999e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.33 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  31.09 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  30.33 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  32.76 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  29.6 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  29.92 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  31.4 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  30.54 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  31.93 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  26.67 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  31.41 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  32.8 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  30.25 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  34.41 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  34.45 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  28.16 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
141 aa  67  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  28.85 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  28.47 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  36.03 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  34.45 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  30.08 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  29.37 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  26.56 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  29.46 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  27.34 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.15 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  27.78 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  35.24 
 
 
260 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  29.55 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  28.91 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  27.2 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  30.58 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  29.46 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  31.5 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  28.69 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  28.16 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  34.74 
 
 
163 aa  61.6  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  34.56 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
204 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
151 aa  61.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  30.58 
 
 
166 aa  60.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 
146 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  29.82 
 
 
129 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 
164 aa  60.5  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  31.5 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  30.47 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>