More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1199 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  30.22 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  31.43 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  31.43 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  31.43 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  31.43 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  31.43 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  31.43 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  31.43 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  30.3 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  27.82 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  30.71 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  30.71 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  30.71 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  30.71 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  25.68 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  30.71 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  30.71 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  25.17 
 
 		 180 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.86 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  26.47 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  30.22 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  36.26 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  36.26 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  29.32 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  34.78 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>