More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2040 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2040  response regulator receiver protein  100 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468442  hitchhiker  0.00313136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  46.03 
 
 		 202 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  46.67 
 
 		 1483 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 211 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 211 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  44.63 
 
 		 212 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  44.63 
 
 		 212 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  44.63 
 
 		 212 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  44.63 
 
 		 212 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  44.63 
 
 		 212 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 214 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  44.63 
 
 		 212 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  44.63 
 
 		 212 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  44.63 
 
 		 212 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 212 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 212 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 212 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 214 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 212 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 212 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  43.8 
 
 		 210 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 212 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 212 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.8 
 
 		 214 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 208 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 210 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 214 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 206 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 215 aa  93.6  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  44.64 
 
 		 205 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 208 aa  92.8  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  39.84 
 
 		 210 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 207 aa  90.9  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 216 aa  90.5  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  42.98 
 
 		 205 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 214 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 214 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 208 aa  89.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 208 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  40 
 
 		 213 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.13 
 
 		 210 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 210 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 209 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.54 
 
 		 214 aa  88.2  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  36.92 
 
 		 198 aa  87.8  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 207 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 203 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 208 aa  87.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 208 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  35.16 
 
 		 204 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  41.23 
 
 		 205 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 208 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 207 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 208 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 208 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.96 
 
 		 212 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 209 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 201 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  40.54 
 
 		 210 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 210 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.19 
 
 		 207 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 211 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  40.65 
 
 		 246 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.35 
 
 		 1445 aa  84.3  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 202 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 212 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 206 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  40.35 
 
 		 203 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  36.8 
 
 		 205 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  83.6  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 203 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  40.5 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  36.07 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  37.5 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  40.18 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5632  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.653856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 205 aa  80.5  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  38.79 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6166  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  38.52 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2866  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2829  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.26 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  41.07 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2118  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  40.54 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1341  response regulator receiver  38.21 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>