293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1675 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
319 aa  651    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  83.56 
 
 
320 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  78.37 
 
 
318 aa  512  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  78.85 
 
 
313 aa  501  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  59.09 
 
 
309 aa  345  7e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  55.73 
 
 
320 aa  323  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  50.46 
 
 
325 aa  312  4.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  53.27 
 
 
313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  41.78 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  40.73 
 
 
355 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  40.45 
 
 
366 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.41 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  33.15 
 
 
374 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  34.13 
 
 
365 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  31.18 
 
 
340 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  33.15 
 
 
371 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  30.38 
 
 
373 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.99 
 
 
357 aa  154  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  32.46 
 
 
364 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.81 
 
 
359 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 
342 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
373 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  31.62 
 
 
415 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.83 
 
 
415 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  32.12 
 
 
438 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.84 
 
 
313 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  28.29 
 
 
423 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  31.87 
 
 
352 aa  146  6e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.36 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 
423 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  31.12 
 
 
377 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  25.92 
 
 
489 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  31.3 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.32 
 
 
365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 
358 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
389 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.5 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  30.45 
 
 
443 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.03 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  31.04 
 
 
371 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 
468 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.49 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
366 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  31.03 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
354 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  32.44 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 
356 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.36 
 
 
308 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  28.41 
 
 
375 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  30.79 
 
 
348 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.08 
 
 
375 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  30.31 
 
 
361 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.51 
 
 
362 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  29.83 
 
 
454 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 
361 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 
349 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 
414 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 
370 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 
434 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  29.6 
 
 
335 aa  122  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 
355 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
400 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  27.72 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  30.16 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
671 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  31.08 
 
 
359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
632 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.86 
 
 
381 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.37 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.4 
 
 
390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 
421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  27.97 
 
 
358 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
310 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 
652 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 
474 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  25.77 
 
 
388 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  27.07 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.81 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 
398 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  28.16 
 
 
431 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  25.62 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.9 
 
 
657 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2924  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 
537 aa  109  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 
406 aa  109  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 
358 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  29.31 
 
 
406 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  24.27 
 
 
415 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 
368 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  24.81 
 
 
393 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 
318 aa  106  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
434 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
429 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.22 
 
 
397 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  24.04 
 
 
488 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>