More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1055 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 270 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  64.29 
 
 		 268 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  62.26 
 
 		 268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  62.78 
 
 		 268 aa  349  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  61.51 
 
 		 268 aa  348  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  61.13 
 
 		 269 aa  344  8e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  60 
 
 		 268 aa  341  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  60 
 
 		 268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2256  tryptophan synthase subunit alpha  64.79 
 
 		 267 aa  338  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  64.77 
 
 		 268 aa  333  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  58.49 
 
 		 269 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  61.13 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  61.13 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  61.13 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  61.13 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  61.13 
 
 		 268 aa  328  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  63.53 
 
 		 268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  60.38 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  60.38 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  60.38 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  60.38 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  60.38 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  60.38 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  60.38 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  60.38 
 
 		 269 aa  323  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  60 
 
 		 268 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1585  tryptophan synthase subunit alpha  61.71 
 
 		 269 aa  322  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  62.5 
 
 		 272 aa  322  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  63.3 
 
 		 267 aa  321  6e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  62.78 
 
 		 278 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2806  tryptophan synthase subunit alpha  63.26 
 
 		 273 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  62.5 
 
 		 278 aa  318  9e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  63.2 
 
 		 281 aa  317  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  63.26 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 273 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 273 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  62.5 
 
 		 278 aa  315  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1937  tryptophan synthase subunit alpha  60.38 
 
 		 268 aa  315  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.66163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2047  tryptophan synthase subunit alpha  60.38 
 
 		 268 aa  314  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1681  tryptophan synthase subunit alpha  62.5 
 
 		 272 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1659  tryptophan synthase subunit alpha  62.41 
 
 		 278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681458  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1523  tryptophan synthase subunit alpha  61.74 
 
 		 278 aa  310  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107227 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2317  tryptophan synthase subunit alpha  60.07 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  58.3 
 
 		 282 aa  308  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  63.02 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02293  tryptophan synthase subunit alpha  57.63 
 
 		 263 aa  291  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  56.34 
 
 		 280 aa  278  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  40.52 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  40.64 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  39.45 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  38.65 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  37.86 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  37.94 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  39.68 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  37.92 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  35.98 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  35.5 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  35.96 
 
 		 275 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  36.02 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  36.86 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  36.15 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  36.29 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  37.8 
 
 		 278 aa  165  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  39.17 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  39.04 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  35.86 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  36.65 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  36.4 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  36.75 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  36.78 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  36.26 
 
 		 272 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  35 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  38.1 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  36.78 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  33.72 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  33.86 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  36.08 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  36.65 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  34.2 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  36.92 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  36.02 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  36.09 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  33.58 
 
 		 265 aa  158  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  35.25 
 
 		 290 aa  158  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  38.2 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  34.8 
 
 		 274 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  35.18 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  33.71 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>