More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4111 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4111  regulatory protein LacI  100 
 
 		 358 aa  736    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  55.87 
 
 		 354 aa  415  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1700  regulatory protein LacI  39.6 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107913  normal  0.016401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  37.86 
 
 		 352 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1274  transcriptional regulator, LacI family  36.92 
 
 		 352 aa  226  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4188  regulatory protein, LacI  34.53 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  25.14 
 
 		 357 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09440  regulatory protein LacI  24.08 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00329545  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  25.38 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  26.36 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  26.47 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  23.36 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2115  sucrose operon repressor  29.41 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  22.67 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.85 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  26.75 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2079  sucrose operon repressor  29.41 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.321013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.69 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28.18 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  22.74 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.39 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  25.53 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0612  LacI family transcription regulator  25.42 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1497  sucrose operon repressor  29.47 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  23.67 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  23.86 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  26.14 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.07 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1712  sucrose operon repressor  25.43 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.772811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  21.49 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  34.92 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2407  LacI family transcription regulator  30.68 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04812  hypothetical protein  24.59 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  24.06 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  21.38 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  26.82 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1480  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.34 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  25.7 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  24.1 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  29.57 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.49 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.57 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  25.34 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3266  transcriptional regulator, LacI family  28.97 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.030441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  24.67 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3331  regulatory protein LacI  33.87 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  20.8 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1078  transcriptional regulator, LacI family  33.87 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5892  LacI family transcription regulator  23.05 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.78 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  24.89 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  21.1 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.05 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.05 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.02 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  28.98 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  21.25 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  27.15 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  27.01 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0763  regulatory protein, LacI  45.59 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  30.07 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2898  transcriptional regulator, LacI family  24.03 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4515  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.88 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  23.71 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  39.53 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  23.71 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  24.92 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  25.58 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  28.19 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  28.19 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  41.43 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  24.05 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  28.19 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  28.19 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  24.18 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  28.19 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  29.41 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  28.19 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  28.19 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  32.03 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2351  LacI family transcription regulator  26.92 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0288432  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3623  LacI family transcription regulator  30.11 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  34.35 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1870  transcriptional regulator, LacI family  20.89 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  30.32 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  27.62 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  22 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  26.82 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1596  maltose operon transcriptional repressor  27.16 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1565  maltose operon transcriptional repressor  27.16 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>