More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5892 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5892  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 335 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  41.69 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4515  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.24 
 
 		 351 aa  242  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1929  LacI family transcription regulator  35.1 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  36.5 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.12 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2612  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00297504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2497  Alanine racemase  35.01 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  30.95 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.97 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  34.6 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1107  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.43 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0307  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0353911  normal  0.19283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02556  hypothetical protein  30.46 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7655  LacI family transcription regulator  30.36 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  32.35 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3245  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3781  transcriptional regulator, LacI family  32 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.74 
 
 		 337 aa  149  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6547  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.758912 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2238  transcriptional regulator  32.25 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  29.66 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.36 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3632  transcriptional regulator, LacI family  26.95 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3173  transcriptional regulator, LacI family  34.28 
 
 		 328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.76 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.55 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6135  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 334 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  0.212508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.96 
 
 		 341 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  30.03 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2850  LacI family transcription regulator  30.33 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3140  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  32.13 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  31.47 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  30.18 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  33.75 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.36 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  28.61 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.66 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4409  transcriptional regulator, LacI family  35.94 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.27 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.36 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.36 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.36 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3049  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.53 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.422318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3274  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3283  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.53 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.116085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.96 
 
 		 341 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  28.05 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  28.9 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0185  alanine racemase  29.18 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  26.83 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  29.7 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  32.81 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.46 
 
 		 347 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 346 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  28.57 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.76 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  26.81 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0812  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171283  normal  0.194495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  30.46 
 
 		 366 aa  135  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.76 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  28.82 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  26.71 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  28.96 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.74 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  32.82 
 
 		 340 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1424  LacI family transcription regulator  27.83 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000379312  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 342 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  31.53 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  32.27 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  29.67 
 
 		 358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.18 
 
 		 348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  28.74 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.25 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  31.38 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 342 aa  132  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2185  LacI family transcription regulator  29.31 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  29.64 
 
 		 353 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 346 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.58 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  28.99 
 
 		 346 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>