More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2850 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2850  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 333 aa  677    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.83 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3781  transcriptional regulator, LacI family  33.95 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1929  LacI family transcription regulator  28.79 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2612  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00297504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1107  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0307  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0353911  normal  0.19283 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1424  LacI family transcription regulator  28.75 
 
 		 332 aa  152  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000379312  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2238  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4515  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.61 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7655  LacI family transcription regulator  28.18 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3344  LacI family transcription regulator  29.66 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000247508  normal  0.28725 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5892  LacI family transcription regulator  30.54 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3173  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0812  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171283  normal  0.194495 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3245  transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0294  transcriptional regulator, LacI family  31.41 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02556  hypothetical protein  30.26 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1273  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.690479  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3114  LacI family transcription regulator  32.99 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0116195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.83 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0942  LacI family transcription regulator  32.24 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4848  transcriptional regulator, LacI family  30.15 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125371  normal  0.0610875 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0612  LacI family transcription regulator  28.92 
 
 		 343 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5997  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.361062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04812  hypothetical protein  26.75 
 
 		 335 aa  135  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5511  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1602  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.76 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3595  LacI family transcription regulator  32.37 
 
 		 340 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4772  LacI family transcription regulator  32.37 
 
 		 340 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3140  transcriptional regulator  29 
 
 		 350 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4155  LacI family transcription regulator  30.75 
 
 		 340 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4679  LacI family transcription regulator  30.75 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6065  transcriptional regulator, LacI family  30.66 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2407  LacI family transcription regulator  29.71 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2465  HTH-type transcriptional regulator, LacI-family  26.59 
 
 		 336 aa  126  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3751  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.38 
 
 		 335 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0183  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 334 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.86 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.73 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3706  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.27 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261904  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6547  transcriptional regulator, LacI family  29.73 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.758912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  28.96 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6135  transcriptional regulator, LacI family  29 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  0.212508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3964  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.49 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0348412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0185  alanine racemase  24.55 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3197  LacI family transcription regulator  29.47 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  31.27 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  28.9 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  29.31 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  28.44 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  28.15 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.72 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.35 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 337 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 343 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  27.66 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  29.2 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  26.98 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  30.18 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0454  LacI family transcription regulator  29.88 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  24.19 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  25.71 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  25.94 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  25.15 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  23.15 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  28.38 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3013  transcriptional regulator, LacI family  30.33 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  25.45 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  26.55 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  29.1 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  27.5 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  28.14 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  23.6 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  28.36 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  25.36 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.12 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  28.82 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  25.53 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.82 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  29.24 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2497  Alanine racemase  27.63 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>