More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0307 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0307  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 338 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0353911  normal  0.19283 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  52.41 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1107  LacI family transcription regulator  47.13 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2238  transcriptional regulator  47.73 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2465  HTH-type transcriptional regulator, LacI-family  38.18 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04812  hypothetical protein  36.31 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0612  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1929  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0812  transcriptional regulator, LacI family  39.82 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171283  normal  0.194495 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3140  transcriptional regulator  40.95 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1273  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.690479  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3344  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000247508  normal  0.28725 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7655  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1424  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000379312  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4515  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.65 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2612  transcriptional regulator, LacI family  35.84 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00297504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3245  transcriptional regulator, LacI family  37.34 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02556  hypothetical protein  33.75 
 
 		 318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  34.74 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6135  transcriptional regulator, LacI family  35.18 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  0.212508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3173  transcriptional regulator, LacI family  36.22 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.22 
 
 		 343 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6547  transcriptional regulator, LacI family  35.31 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.758912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0942  LacI family transcription regulator  34.64 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0294  transcriptional regulator, LacI family  34.33 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4679  LacI family transcription regulator  35.13 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3595  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4772  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2497  Alanine racemase  35.42 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4155  LacI family transcription regulator  34.33 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6065  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3964  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.14 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0348412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3751  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.42 
 
 		 335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1602  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.84 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5511  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 344 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3114  LacI family transcription regulator  34.38 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0116195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33670  LacI family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3197  LacI family transcription regulator  34.09 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0183  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2407  LacI family transcription regulator  34.11 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5997  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.361062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  30.97 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.63 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2850  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1712  sucrose operon repressor  30.21 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.772811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  28.48 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  31.94 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0185  alanine racemase  29.47 
 
 		 349 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  34.93 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.56 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.36 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.42 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  29.82 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  29.82 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5892  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  32.78 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 340 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1601  alanine racemase  28.45 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.520299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  29.52 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 		 334 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3706  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.51 
 
 		 359 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 331 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  29.22 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  30.88 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  29.22 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  29.22 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  31.95 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2503  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  28.44 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.93 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  28.92 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  28.92 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  32.7 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  31.99 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  28.92 
 
 		 323 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.03 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  32.69 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  31.33 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.93 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  27.89 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6824  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 355 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  29.25 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 		 343 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  28.83 
 
 		 337 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  29.51 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>