More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0812 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0812  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 342 aa  672    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171283  normal  0.194495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2612  transcriptional regulator, LacI family  49.54 
 
 		 339 aa  276  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00297504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.72 
 
 		 342 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0307  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 		 338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0353911  normal  0.19283 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1929  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 347 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1107  LacI family transcription regulator  40.26 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3173  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0942  LacI family transcription regulator  40.41 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2238  transcriptional regulator  38.07 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3595  LacI family transcription regulator  40.26 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4772  LacI family transcription regulator  40.26 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819593 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4679  LacI family transcription regulator  39.77 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4515  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.88 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6547  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.758912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1424  LacI family transcription regulator  37.04 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000379312  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04812  hypothetical protein  33.63 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1273  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.690479  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5511  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4155  LacI family transcription regulator  40.23 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3245  transcriptional regulator, LacI family  39.23 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6135  transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  0.212508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02556  hypothetical protein  35.11 
 
 		 318 aa  185  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0612  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 343 aa  185  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2465  HTH-type transcriptional regulator, LacI-family  33.13 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  36.83 
 
 		 332 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3344  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000247508  normal  0.28725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2497  Alanine racemase  38.14 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7655  LacI family transcription regulator  36.11 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  36.25 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0294  transcriptional regulator, LacI family  35.82 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0185  alanine racemase  30.21 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.92 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.08 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3114  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0116195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3964  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.93 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0348412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 386 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1602  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.42 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.55 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0183  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3706  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.03 
 
 		 359 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  32.42 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3140  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6065  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33670  LacI family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 		 346 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5997  transcriptional regulator, LacI family  33.62 
 
 		 336 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.361062  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  29.32 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  29.32 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  30.89 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  33.93 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  34.35 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  29.01 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  29.01 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  32.45 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  28.7 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  28.7 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  28.7 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3197  LacI family transcription regulator  31.58 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3751  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.94 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  32 
 
 		 333 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  28.7 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.12 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2850  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 333 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  32.83 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1181  alanine racemase  32.54 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331058  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  32.83 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.54 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  28.4 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  29.74 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  32.83 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0271  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  31.63 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2545  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.82 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  32.83 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2557  LacI family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000811694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  32.52 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.95 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  27.19 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  31.73 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  27.79 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0485  transcriptional repressor, LacI family  34.23 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  36.14 
 
 		 359 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 337 aa  132  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1823  transcriptional regulator, LacI family  32.33 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.13 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  31.4 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>