More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1424 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1424  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 332 aa  677    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000379312  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3344  LacI family transcription regulator  71.99 
 
 		 334 aa  510  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000247508  normal  0.28725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1273  transcriptional regulator  71.69 
 
 		 332 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.690479  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1929  LacI family transcription regulator  32.13 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0812  transcriptional regulator, LacI family  37.04 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171283  normal  0.194495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0307  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0353911  normal  0.19283 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1107  LacI family transcription regulator  38.36 
 
 		 345 aa  189  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4515  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.73 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3197  LacI family transcription regulator  35.92 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2238  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.66 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7655  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2465  HTH-type transcriptional regulator, LacI-family  31.34 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04812  hypothetical protein  32.53 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2407  LacI family transcription regulator  34.64 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.2 
 
 		 347 aa  165  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  31.44 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0942  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3140  transcriptional regulator  36.39 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3173  transcriptional regulator, LacI family  34.55 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.79 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  31.18 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3595  LacI family transcription regulator  35.6 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4772  LacI family transcription regulator  35.6 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3245  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5511  LacI family transcription regulator  34.9 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02556  hypothetical protein  32.62 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  31.7 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4679  LacI family transcription regulator  34.05 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2497  Alanine racemase  33.03 
 
 		 338 aa  155  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 337 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4155  LacI family transcription regulator  34.39 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4848  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125371  normal  0.0610875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33670  LacI family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.5 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6135  transcriptional regulator, LacI family  32.82 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  0.212508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.65 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0612  LacI family transcription regulator  30.36 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.14 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  35.37 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 337 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6547  transcriptional regulator, LacI family  32.21 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.758912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3061  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.53 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.69 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  30.79 
 
 		 324 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1273  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  30.24 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.95 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  31.33 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  31.33 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  31.83 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  29.9 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  31.91 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  29.75 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 		 353 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.64 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  31.02 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.12 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.45 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  30.81 
 
 		 368 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  31.45 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.78 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.02 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2612  transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00297504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  30.72 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  30.72 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  30.72 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5997  transcriptional regulator, LacI family  33.54 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.361062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5609  transcriptional regulator, LacI family  31.88 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.918493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  30.72 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.04 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  27.96 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  33.9 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  28.79 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  30.12 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2850  LacI family transcription regulator  29.05 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.38 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  29.38 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.38 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.38 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  29.38 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  32.09 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.38 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9131  transcriptional regulator LacI family  29.03 
 
 		 356 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.38 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>