239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3500 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  100 
 
 		 248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  57.69 
 
 		 231 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  53.62 
 
 		 236 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  39.91 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  40.43 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  38.78 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  37.87 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  35.74 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  35.4 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  37.02 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  35.84 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  35.81 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  39.83 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  38.86 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  41 
 
 		 198 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  33.05 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  36.64 
 
 		 214 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  35.5 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  33.04 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  38.79 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  36.25 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  35.9 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  31.9 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  36.4 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  30.83 
 
 		 269 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  32.74 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  38.36 
 
 		 225 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  32.38 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  35.5 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  36.68 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  32.46 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  30.8 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  33.16 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  28.51 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  31.06 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  36.36 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  42.64 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  30.25 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  31.06 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  37.24 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.69 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.4 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  27.6 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  34.51 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  35.17 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.71 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  32.89 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 519 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.17 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  26.34 
 
 		 520 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  33.57 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  39.29 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  28.65 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  30.17 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  34.23 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  30.67 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  29 
 
 		 500 aa  55.1  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  26.34 
 
 		 521 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  31.76 
 
 		 534 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  31.76 
 
 		 537 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  29.89 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  30.34 
 
 		 578 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  35.97 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  35.97 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  30.82 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  31.51 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  28.65 
 
 		 313 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 475 aa  52.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 		 193 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  31.54 
 
 		 185 aa  52.4  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.27 
 
 		 519 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 		 209 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.47 
 
 		 462 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  32.84 
 
 		 525 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  32.62 
 
 		 184 aa  52  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  30.52 
 
 		 185 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  30.26 
 
 		 204 aa  52  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  30.98 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  31.54 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  27.12 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  31.08 
 
 		 534 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  31.08 
 
 		 534 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  30.87 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  32.21 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  31.43 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.05 
 
 		 665 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  35.17 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  31.94 
 
 		 511 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  31.08 
 
 		 534 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  31.08 
 
 		 534 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  31.08 
 
 		 537 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  31.21 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  25.32 
 
 		 549 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  27.32 
 
 		 190 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  27.32 
 
 		 190 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  27.32 
 
 		 190 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>