114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3435 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  100 
 
 		 475 aa  989    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  32.95 
 
 		 489 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  32.95 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  33.94 
 
 		 469 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  34.98 
 
 		 460 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  28.01 
 
 		 702 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00050  conserved hypothetical protein  28.31 
 
 		 558 aa  87.4  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.365734  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11069  alkaline phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G03860)  32.16 
 
 		 619 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  23.4 
 
 		 569 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  23.4 
 
 		 569 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  23.4 
 
 		 569 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  26.03 
 
 		 566 aa  75.1  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  25.53 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  27.72 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  25.09 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  26.06 
 
 		 542 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  24.84 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  26.35 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  24.71 
 
 		 727 aa  70.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.95 
 
 		 524 aa  67  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  27.68 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  26.46 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  25.68 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  22.83 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  30.38 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  24.66 
 
 		 530 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  25.35 
 
 		 590 aa  63.9  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  25.83 
 
 		 559 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  24.41 
 
 		 616 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  23.99 
 
 		 531 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3028  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  24.71 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  26.29 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  22.25 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  25 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  26.7 
 
 		 661 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  24.68 
 
 		 649 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  24.77 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  25.75 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  27.13 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  23.3 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  25.68 
 
 		 626 aa  57  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  25.16 
 
 		 473 aa  57  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  27.98 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  27.71 
 
 		 636 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  22.95 
 
 		 529 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3408  alkaline phosphatase D domain-containing protein  21.33 
 
 		 370 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  22.94 
 
 		 529 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3815  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  24.14 
 
 		 637 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  24.28 
 
 		 528 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4422  alkaline phosphatase D domain-containing protein  22.1 
 
 		 369 aa  53.5  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  23.37 
 
 		 534 aa  53.5  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  24.63 
 
 		 563 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  26.6 
 
 		 514 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  24.26 
 
 		 521 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  24.43 
 
 		 628 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  24.43 
 
 		 616 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  24.38 
 
 		 615 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  23.97 
 
 		 633 aa  52  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  22.86 
 
 		 678 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  26.09 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  26.46 
 
 		 622 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  24.38 
 
 		 615 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  23.27 
 
 		 616 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  24.31 
 
 		 529 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  25.23 
 
 		 577 aa  50.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  28.8 
 
 		 516 aa  50.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  23.98 
 
 		 628 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  26.38 
 
 		 539 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  20.63 
 
 		 529 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0226  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  22.48 
 
 		 471 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549857  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  21.22 
 
 		 538 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  23.77 
 
 		 623 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  24.66 
 
 		 632 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  26.51 
 
 		 616 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  24.14 
 
 		 646 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  27.23 
 
 		 616 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  24.8 
 
 		 670 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  23.26 
 
 		 545 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  24.76 
 
 		 621 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  27.23 
 
 		 617 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  25.69 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  24.74 
 
 		 648 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45959  phosphodiesterase/alkaline phosphatase  22.69 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.825873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  22.64 
 
 		 523 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  21.43 
 
 		 573 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  22.47 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  36 
 
 		 710 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  21.07 
 
 		 573 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  25.39 
 
 		 547 aa  47.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  24.81 
 
 		 1298 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  25.69 
 
 		 619 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  26.74 
 
 		 532 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  25.26 
 
 		 530 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  22.65 
 
 		 618 aa  47  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  25.96 
 
 		 527 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  23.98 
 
 		 648 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  22.71 
 
 		 523 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  23.81 
 
 		 552 aa  46.6  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  24.84 
 
 		 555 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  46.15 
 
 		 679 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>