272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3197 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3197  putative FecR  100 
 
 		 312 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0381932  hitchhiker  0.0038104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  53.72 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  52.94 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1077  putative FecR  37.43 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  39.17 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  40.38 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  37.31 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  37.15 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  34.07 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0481  putative FecR  36.59 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  35.02 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2206  putative FecR  33.75 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.964925  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2213  putative FecR  34.18 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  29.43 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  32.99 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  29.39 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  31.91 
 
 		 324 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.23 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  27.69 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  32.76 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  29.45 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  32.55 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  31.27 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  31.85 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  29.9 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  29.56 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  33.13 
 
 		 353 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  29.73 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  32.26 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  27.24 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  27.52 
 
 		 334 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  31.27 
 
 		 329 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  31.1 
 
 		 331 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  26.89 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  32.96 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  27.53 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  31.93 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  25.77 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  26.13 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  30.06 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  26.25 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  26.09 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  30.64 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  27.59 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  29.05 
 
 		 340 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  31.8 
 
 		 331 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  28.93 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  25.48 
 
 		 334 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  23.91 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  32.83 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  30.45 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  28.52 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  30.11 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6087  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  26.2 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  31.15 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  26.35 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  32.33 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  28.17 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  31.02 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  27.27 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  29.17 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  27.99 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  31.14 
 
 		 326 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  30.38 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  31.14 
 
 		 326 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  27.91 
 
 		 327 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  26.6 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5188  putative FecR  29.58 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  29.43 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0691  anti-FecI sigma factor, FecR  30.28 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  25.78 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  26.85 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  28.12 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  26.65 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  29.09 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  31.8 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  26.89 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  24.54 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  24.69 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  24.4 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  25.16 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  29.82 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  30.77 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2338  anti-FecI sigma factor, FecR  31.02 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  26.28 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  26.2 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  24.48 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  27.71 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  27.74 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  30.18 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  26.04 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3811  anti-FecI sigma factor, FecR  24.31 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0610777  normal  0.956547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  29.6 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  27.93 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  29.8 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>