195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2704 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 388 aa  763    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  90.72 
 
 		 388 aa  699    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  43.42 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 		 386 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  35.94 
 
 		 404 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 386 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  36.8 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  36.53 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  36.53 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  36.53 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  36.53 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 382 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  34.97 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  34.68 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 379 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  33.99 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  34.23 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  33.43 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  27.79 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 413 aa  115  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 394 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  23.43 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  23.43 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4671  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  23.71 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  22.34 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  22.38 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  22.34 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0947  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  26.14 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  22.39 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  23.45 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  22.97 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  26.85 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  24.63 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  26.4 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  25.45 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  23.6 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  23.6 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  23.6 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  23.6 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  24.01 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  23.6 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>