More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1636 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1636  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 366 aa  759    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1748  hypothetical protein  27.19 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  28.37 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  30.11 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.94 
 
 		 521 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  31.68 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  30.92 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  22.64 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  28.02 
 
 		 734 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  30.92 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  25.84 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  29.94 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.73 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.73 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.42 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  32.52 
 
 		 214 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  29.45 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  35.9 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  31.37 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  35.9 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 576 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.71 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  30.82 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 710 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  31.51 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  29.33 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  23.17 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  23.3 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  28.43 
 
 		 600 aa  63.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  31.3 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.49 
 
 		 525 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  30.54 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  29.92 
 
 		 182 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  31.97 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  30.51 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  32.46 
 
 		 872 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  22.83 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  30.18 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  29.33 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.91 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  32.54 
 
 		 961 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  30.25 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  31.62 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  29.05 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  32.46 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  27.36 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  28.04 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  32.03 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  29.35 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  30.39 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  29.79 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.56 
 
 		 949 aa  59.7  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3601  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.78 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  29.36 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  29.3 
 
 		 227 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  27.08 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  27.85 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  27.08 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  27.08 
 
 		 862 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2505  pentapeptide repeat protein  30.15 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  26.98 
 
 		 706 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  27.08 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  29.45 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  24.81 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  31.78 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  30.38 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  31.71 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  27.08 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  30.25 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  29.13 
 
 		 776 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  27.08 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  30.25 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  28.93 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  27.36 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.59 
 
 		 515 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  27.54 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  26.61 
 
 		 872 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  29.01 
 
 		 825 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 533 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  26.81 
 
 		 174 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  32.48 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  27.97 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.58 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  27.63 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.58 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  28.97 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  31.45 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  27.81 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1060  pentapeptide repeat-containing protein  27.87 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  30.08 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0631  pentapeptide repeat protein  28.95 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>