More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4958 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  69.41 
 
 		 553 aa  764    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  70.02 
 
 		 557 aa  730    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  69.08 
 
 		 551 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  70.65 
 
 		 551 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.09 
 
 		 552 aa  729    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  100 
 
 		 553 aa  1108    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  70.52 
 
 		 551 aa  755    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  59.29 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.26 
 
 		 611 aa  601  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  59.07 
 
 		 621 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  59.55 
 
 		 624 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  59.55 
 
 		 624 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  59.25 
 
 		 624 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  59.55 
 
 		 624 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  56.5 
 
 		 665 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 		 613 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  57.2 
 
 		 546 aa  581  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  54.68 
 
 		 603 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  55.87 
 
 		 614 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.41 
 
 		 614 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  53.42 
 
 		 613 aa  574  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  55.29 
 
 		 613 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  56.48 
 
 		 550 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  56.88 
 
 		 582 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  48.89 
 
 		 543 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  47.4 
 
 		 551 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  49.53 
 
 		 540 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  48.52 
 
 		 543 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  48.13 
 
 		 540 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  47.96 
 
 		 551 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  48.52 
 
 		 543 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  46.78 
 
 		 545 aa  483  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  48.13 
 
 		 540 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  47.72 
 
 		 535 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  47.67 
 
 		 538 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  45.42 
 
 		 531 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  46.28 
 
 		 530 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  39.59 
 
 		 565 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  41.68 
 
 		 538 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  40.46 
 
 		 532 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  40.44 
 
 		 563 aa  362  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.35 
 
 		 600 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  42.8 
 
 		 534 aa  360  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  41.17 
 
 		 541 aa  359  7e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  41.05 
 
 		 544 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.63 
 
 		 555 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  41.76 
 
 		 556 aa  357  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  41.21 
 
 		 537 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  40.14 
 
 		 573 aa  355  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  38.72 
 
 		 547 aa  353  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 		 539 aa  352  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  39.58 
 
 		 543 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.84 
 
 		 616 aa  350  3e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  42.16 
 
 		 545 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  41.8 
 
 		 546 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  39.1 
 
 		 555 aa  349  8e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  39.43 
 
 		 570 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  39.63 
 
 		 566 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 607 aa  348  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  40.56 
 
 		 563 aa  347  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  38.54 
 
 		 603 aa  347  5e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  37.73 
 
 		 541 aa  346  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  38.19 
 
 		 576 aa  346  6e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  39.7 
 
 		 539 aa  346  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  39.85 
 
 		 550 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2700  ABC oligo/dipeptide transporter, fused ATPase subunits  38.6 
 
 		 659 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  40.37 
 
 		 533 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  39.38 
 
 		 557 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  37.69 
 
 		 553 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  39.52 
 
 		 565 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  42.66 
 
 		 545 aa  344  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  39.73 
 
 		 547 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  37.48 
 
 		 561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  38.82 
 
 		 555 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 		 550 aa  343  4e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  37.48 
 
 		 565 aa  343  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  38.73 
 
 		 539 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  38.46 
 
 		 575 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 536 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  39.33 
 
 		 539 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 543 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.17 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  40.78 
 
 		 540 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  38.61 
 
 		 549 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  39.23 
 
 		 564 aa  342  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  39.11 
 
 		 545 aa  341  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  38.43 
 
 		 555 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  37.52 
 
 		 545 aa  341  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  41.74 
 
 		 534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 		 539 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  37.8 
 
 		 542 aa  340  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  38.17 
 
 		 569 aa  340  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  39.52 
 
 		 552 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  36.12 
 
 		 522 aa  340  5e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  40.81 
 
 		 554 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  38.08 
 
 		 547 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  40.56 
 
 		 540 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 548 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  39.63 
 
 		 541 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1357  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.77 
 
 		 659 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28594  normal  0.0160708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>