More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3146 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 167 aa  334  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  81.07 
 
 		 169 aa  271  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  76.79 
 
 		 169 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  72.78 
 
 		 168 aa  254  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  66.27 
 
 		 168 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  63.47 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  63.1 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  58.24 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  60.36 
 
 		 166 aa  190  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  55.69 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  55.36 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  55.36 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  57.23 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  57.23 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  56 
 
 		 173 aa  183  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  55.29 
 
 		 171 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  53.85 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  48.5 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  46.43 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  46.06 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  49.68 
 
 		 204 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  39.89 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  40.43 
 
 		 189 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  44.1 
 
 		 189 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  35.36 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.77 
 
 		 189 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 189 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  38.6 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  38.82 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  36.88 
 
 		 142 aa  97.1  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  41.43 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 		 197 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  33.73 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  40.29 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  38.16 
 
 		 231 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  35.59 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 186 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 		 158 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 		 180 aa  90.9  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4589  hypothetical protein  88 
 
 		 67 aa  90.5  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.780725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  39.34 
 
 		 150 aa  90.5  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  37.93 
 
 		 198 aa  90.5  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  35.58 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  38 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  36.92 
 
 		 141 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  41.06 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  41.06 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  39.74 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  88.6  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 134 aa  88.6  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  33.93 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  32.72 
 
 		 142 aa  88.2  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  87.8  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 		 156 aa  87.8  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  33.93 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.46 
 
 		 147 aa  85.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  35.97 
 
 		 132 aa  85.5  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  39.67 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  29.61 
 
 		 166 aa  84.7  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  34.03 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  34.03 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  36.42 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  41.28 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  35.21 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  35.25 
 
 		 132 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  35.53 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.13 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  32.87 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  37.5 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  38.6 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  37.82 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>