83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4589 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4589  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  137  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.780725 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  88 
 
 
167 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  84.31 
 
 
169 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  72.55 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  76.47 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  75.51 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  68.63 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  67.35 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  70.21 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  65.31 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  66 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  58.82 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  58.82 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  60 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  61.22 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  61.22 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  58 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  54 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  50 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  48.08 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  48 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  49.02 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 
162 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  46.94 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 
204 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  43.64 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  48.08 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  48.08 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  49.06 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  48.21 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  46.15 
 
 
231 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  48.08 
 
 
189 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  45.28 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
184 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  42.31 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  48.08 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
166 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.46 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  43.4 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  38.46 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.94 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
158 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  36 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  33.33 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
173 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
150 aa  40.8  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1098  heat shock protein Hsp20  45.1 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.358342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1109  heat shock protein Hsp20  45.1 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223131  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
170 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
164 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
169 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
158 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  42.31 
 
 
143 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>