More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2048 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2048  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
249 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1767  homoserine/homoserine lactone efflux pump  86.35 
 
 
249 aa  404  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  60 
 
 
224 aa  268  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  30.9 
 
 
213 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  33.2 
 
 
210 aa  118  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.47 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.19 
 
 
211 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
208 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.19 
 
 
211 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.47 
 
 
211 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  32.19 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.76 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  31.76 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  31.76 
 
 
222 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  31.76 
 
 
222 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  30.9 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.33 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  31.47 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  31.33 
 
 
222 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  31.17 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 
205 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.19 
 
 
211 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  32.19 
 
 
211 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.64 
 
 
208 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  31.2 
 
 
218 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 
214 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  28.75 
 
 
208 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.11 
 
 
205 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.54 
 
 
212 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.99 
 
 
208 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 
212 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  31.47 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 
203 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  30.17 
 
 
207 aa  99  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  29.74 
 
 
229 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  30.17 
 
 
207 aa  99  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  30.17 
 
 
207 aa  99  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 
203 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  30.96 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  29.31 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
217 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  30.83 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  29.74 
 
 
207 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.31 
 
 
207 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  29.31 
 
 
229 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 
203 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.05 
 
 
207 aa  95.9  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  29.31 
 
 
207 aa  95.9  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 
205 aa  95.9  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 
213 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  30.8 
 
 
207 aa  95.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  31.76 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 
210 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  26.72 
 
 
205 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 
213 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  27.51 
 
 
206 aa  92  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  28.45 
 
 
214 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  31.28 
 
 
206 aa  92  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.71 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  28.75 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
207 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2156  lysine exporter protein LysE/YggA  29.49 
 
 
205 aa  89  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
207 aa  89  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  29.18 
 
 
204 aa  89  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  29 
 
 
211 aa  89  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  30.71 
 
 
213 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.19 
 
 
207 aa  88.6  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29 
 
 
206 aa  88.6  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  31.08 
 
 
210 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  26.5 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  27.31 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.62 
 
 
213 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1869  lysine exporter protein LysE/YggA  29.78 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.051717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.18 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  27.47 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  30.29 
 
 
213 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.376522  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.15 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.55 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0692  lysine exporter protein LysE/YggA  26.78 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  29.18 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.15 
 
 
207 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  29.96 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  26.11 
 
 
212 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.09 
 
 
206 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.78 
 
 
213 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  26.89 
 
 
207 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3381  lysine exporter protein LysE/YggA  26.78 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.63 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4986  lysine exporter protein LysE/YggA  26.78 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0538724  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  26.84 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5301  lysine exporter protein LysE/YggA  25.94 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.27 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.27 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.27 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.27 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>