More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0661 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0661  peptidase M23B  100 
 
 
270 aa  552  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0851983  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0690  hypothetical protein  91.91 
 
 
272 aa  494  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000105765  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1756  peptidase M23B  57.93 
 
 
272 aa  305  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657093  decreased coverage  0.0000000551494 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  38.71 
 
 
257 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  31.72 
 
 
246 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  36.55 
 
 
284 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  33.56 
 
 
285 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  33.96 
 
 
293 aa  148  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  34.85 
 
 
262 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  34.85 
 
 
262 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  35.1 
 
 
260 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  34.21 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  31.19 
 
 
297 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  33.33 
 
 
256 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  31.01 
 
 
264 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  33.46 
 
 
270 aa  135  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  35.35 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  31.8 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  31.95 
 
 
288 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  33.45 
 
 
315 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  36.61 
 
 
301 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  35.56 
 
 
261 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  32.61 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  30.92 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  36.65 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  35.83 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  30.39 
 
 
285 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  38.05 
 
 
296 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  35.15 
 
 
298 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  32.25 
 
 
312 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  35.15 
 
 
292 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  35.5 
 
 
328 aa  128  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  35.15 
 
 
296 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  35.15 
 
 
296 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  35.15 
 
 
296 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  35.15 
 
 
296 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  35.15 
 
 
296 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  36.49 
 
 
296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  36.49 
 
 
296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  33.81 
 
 
294 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  36.4 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  32.21 
 
 
288 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  33.46 
 
 
311 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  37.04 
 
 
238 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  33.77 
 
 
292 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  31.6 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  35.24 
 
 
251 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  35.24 
 
 
251 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  35.24 
 
 
251 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  32.93 
 
 
298 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  32.35 
 
 
285 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  35.24 
 
 
251 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  35.71 
 
 
250 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  37.74 
 
 
230 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  33.33 
 
 
323 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  30.25 
 
 
333 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  35.24 
 
 
251 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  32.86 
 
 
230 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  32.86 
 
 
230 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  32.24 
 
 
298 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  43.94 
 
 
307 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  35.71 
 
 
250 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  32.43 
 
 
261 aa  122  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  35.71 
 
 
250 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  33.77 
 
 
290 aa  122  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  35.71 
 
 
250 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  36.67 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  35.71 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  31 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  32.35 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  33.2 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  37.74 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  32.61 
 
 
283 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  35.38 
 
 
296 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  30.62 
 
 
298 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  35.38 
 
 
236 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  31.58 
 
 
286 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.38 
 
 
296 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  36.19 
 
 
251 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  36.19 
 
 
251 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  33.19 
 
 
318 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  30.94 
 
 
329 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  30.89 
 
 
298 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  30.89 
 
 
298 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  35.24 
 
 
250 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  34.62 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  35.38 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.38 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  30.62 
 
 
298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.38 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.38 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  34.32 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  30.62 
 
 
298 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  30 
 
 
293 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  30.65 
 
 
331 aa  118  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1246  novel lipoprotein homolog NlpD  33.2 
 
 
247 aa  118  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1246  novel lipoprotein homolog NlpD  33.2 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  36.87 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  31.68 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  33.64 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>