More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0657 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0657  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
618 aa  1265    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0907  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
919 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.651038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  31.87 
 
 
1346 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  38.67 
 
 
882 aa  166  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  36.48 
 
 
1322 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
880 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
1032 aa  161  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
846 aa  160  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  29.32 
 
 
968 aa  160  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
633 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
631 aa  158  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
863 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
923 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  31.33 
 
 
952 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
1240 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
950 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  35.5 
 
 
914 aa  153  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
925 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
1550 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
864 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  34.19 
 
 
918 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
705 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
627 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  33.57 
 
 
918 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
597 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  29.77 
 
 
1407 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
879 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 
818 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
1059 aa  150  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
767 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
1011 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  36.44 
 
 
1119 aa  150  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
818 aa  150  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 
1003 aa  150  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 
1001 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.27 
 
 
1653 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0642  sensor histidine kinase/response regulator  26.82 
 
 
1385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
866 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 
738 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 
909 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.28 
 
 
1109 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
1226 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
1022 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  27.62 
 
 
917 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
676 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
957 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 
947 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
782 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  31.68 
 
 
858 aa  147  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
914 aa  147  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
643 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
645 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
1002 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  31.87 
 
 
931 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  33.91 
 
 
988 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  33.91 
 
 
1032 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  33.91 
 
 
1014 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 
850 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
643 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
948 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
1271 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
944 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
921 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
643 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 
744 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
957 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2671  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
841 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 
1305 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
977 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5219  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
1029 aa  145  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  35.87 
 
 
1353 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
919 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
682 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
681 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000333563  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1691 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
874 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
806 aa  144  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
1044 aa  144  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  33.77 
 
 
497 aa  144  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
1433 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  32.05 
 
 
464 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
643 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
1023 aa  143  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  28 
 
 
917 aa  143  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1982  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1058 aa  143  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  32.44 
 
 
645 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
1066 aa  143  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  33.19 
 
 
651 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
572 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0636  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
535 aa  143  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318643  normal  0.125988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 
1199 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.75 
 
 
955 aa  143  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
1363 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
956 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
1005 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.09 
 
 
1468 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3288  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 
1032 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314025 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  26.89 
 
 
949 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.43 
 
 
949 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05352  histidine kinase  33.33 
 
 
859 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>