155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0152 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0152  putative 4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
336 aa  697    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0141  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  82.12 
 
 
319 aa  547  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.186701  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0121  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase-like protein  40.12 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.3 
 
 
271 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.39 
 
 
271 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.19 
 
 
271 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.63 
 
 
271 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.86 
 
 
271 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.03 
 
 
271 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  26.6 
 
 
288 aa  95.9  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.51 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.13 
 
 
271 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.55 
 
 
271 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  27.81 
 
 
273 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  26.56 
 
 
278 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.21 
 
 
271 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.85 
 
 
265 aa  85.9  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.21 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  28.66 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  27.96 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  32.14 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.82 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  28.3 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.44 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  29 
 
 
269 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.79 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  27.69 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  27.3 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.89 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  28.33 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  26.77 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.84 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.15 
 
 
269 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.91 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.15 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.15 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.83 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.42 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  26.01 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  27.66 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.84 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  24.83 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  27.12 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.56 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  24.52 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  25.5 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.68 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  27.12 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  34.17 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  26.8 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.17 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  26.8 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.17 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  25.17 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.17 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.17 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.75 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.59 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.67 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  25.44 
 
 
275 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  26.45 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  26.45 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  23.81 
 
 
286 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  23.43 
 
 
271 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  26.23 
 
 
271 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.49 
 
 
268 aa  63.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  25.89 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.3 
 
 
277 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  28.71 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  27.1 
 
 
277 aa  60.1  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.67 
 
 
268 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.67 
 
 
268 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  23.24 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  26.67 
 
 
294 aa  59.7  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  20.68 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  23.71 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.33 
 
 
268 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  29.52 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0580  aminotransferase class IV  23.08 
 
 
284 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  28.22 
 
 
287 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  25.12 
 
 
297 aa  56.2  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  20.34 
 
 
281 aa  56.2  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.7 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  26.44 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  27.44 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  29.36 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  23.35 
 
 
298 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  28.14 
 
 
286 aa  53.9  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  23.35 
 
 
298 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  23.35 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  23.35 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  23.35 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  23.35 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  23.35 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 
293 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>