More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0338 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  100 
 
 		 145 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  73.79 
 
 		 142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  72.34 
 
 		 145 aa  213  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  62.41 
 
 		 136 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  60 
 
 		 145 aa  159  9e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  54.48 
 
 		 142 aa  143  9e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  51.97 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  50.34 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  53.17 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  52.76 
 
 		 141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  51.67 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  40.97 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  46.22 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  46.15 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  45.38 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  47.58 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  45.74 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  46.28 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  42.07 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  43.55 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  45.22 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  42.37 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  43.61 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  41.67 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  45.53 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  42.15 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  44.14 
 
 		 688 aa  89.4  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  43.14 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  43.24 
 
 		 688 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  43.08 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  43.1 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  37.4 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  42.02 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  31.75 
 
 		 625 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  37.04 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  32.86 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  40.71 
 
 		 688 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 618 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.75 
 
 		 625 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  38.71 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  39.52 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  37.69 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.7 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  39.23 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  41.18 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  40.35 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  39.02 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 		 643 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  46.25 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  35.92 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  34.31 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  34.19 
 
 		 486 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  36 
 
 		 689 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  34.43 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  34.33 
 
 		 622 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  36.15 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  31.15 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  34.86 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  36.15 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  34.33 
 
 		 644 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  34.45 
 
 		 644 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  36.15 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  36.15 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.04 
 
 		 603 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  33.08 
 
 		 629 aa  68.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.04 
 
 		 603 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  37.07 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  36.61 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  34.21 
 
 		 623 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  36.61 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.04 
 
 		 603 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  35.4 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  28.57 
 
 		 641 aa  68.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  35.38 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  31.78 
 
 		 626 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  34.96 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  37.04 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  40.37 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.61 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 837 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  39.64 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  29.13 
 
 		 626 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  37.39 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  33.58 
 
 		 645 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.6 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 		 624 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  39.17 
 
 		 120 aa  66.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  35.38 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  40.54 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  36.79 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  31.01 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>