More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1168 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  55.7 
 
 		 299 aa  332  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  55.16 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  43.86 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  38.72 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  42.27 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  42.54 
 
 		 323 aa  195  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  38.62 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  45.05 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  40.59 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  35.81 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  42.01 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  41.85 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  40.82 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  38.02 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  38.16 
 
 		 335 aa  168  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  35.41 
 
 		 330 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  37.7 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  35.81 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  35.17 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  38.05 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  39.63 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  36.67 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  38.71 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  37.31 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  35.37 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.19 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  31.45 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  34.85 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  30.56 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  34.86 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  34.18 
 
 		 250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.64 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  34.25 
 
 		 232 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  35.96 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  37.08 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  35.39 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  31.3 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  35.39 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  33.64 
 
 		 217 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  30.65 
 
 		 233 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  30.49 
 
 		 233 aa  95.9  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  30.74 
 
 		 233 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.64 
 
 		 217 aa  95.9  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.49 
 
 		 496 aa  95.9  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  33.16 
 
 		 751 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  30.49 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.4 
 
 		 730 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  27.94 
 
 		 784 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1658  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 		 219 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653687  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  31 
 
 		 766 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  30.37 
 
 		 747 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.56 
 
 		 225 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  38.86 
 
 		 438 aa  92.8  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  31.02 
 
 		 225 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  32.29 
 
 		 719 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  31.94 
 
 		 225 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  31.02 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.62 
 
 		 234 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.55 
 
 		 453 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  32.29 
 
 		 719 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  32.29 
 
 		 719 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  32.29 
 
 		 719 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  31.25 
 
 		 720 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  32.29 
 
 		 719 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  31.05 
 
 		 743 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  28.68 
 
 		 734 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.91 
 
 		 492 aa  89.7  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  31.63 
 
 		 225 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  31.77 
 
 		 764 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  33.48 
 
 		 737 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.24 
 
 		 240 aa  89.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  29.26 
 
 		 503 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  35.19 
 
 		 739 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  33.67 
 
 		 790 aa  89.4  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  35.19 
 
 		 739 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  35.19 
 
 		 739 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  35.19 
 
 		 739 aa  89  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  32.14 
 
 		 524 aa  89  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  30.09 
 
 		 225 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  31.72 
 
 		 795 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  35.06 
 
 		 802 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  29.11 
 
 		 737 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  33.49 
 
 		 464 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  31.92 
 
 		 753 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  30.04 
 
 		 726 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  34.52 
 
 		 803 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  35.98 
 
 		 508 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2965  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  28.99 
 
 		 735 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  34.71 
 
 		 735 aa  86.7  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.62 
 
 		 741 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  29.84 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1016  hypothetical protein  32.39 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  33.95 
 
 		 605 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.94 
 
 		 228 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.94 
 
 		 228 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  36.02 
 
 		 505 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  30.59 
 
 		 721 aa  85.9  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  34.9 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>