57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0416 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  58.04 
 
 		 225 aa  281  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  57.14 
 
 		 225 aa  269  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  52.47 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  48.44 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  48.23 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  48 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  45.95 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  44.74 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  47.35 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  45.09 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  44.64 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  45.54 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  45.09 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  43.17 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  44.59 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  46.12 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  45.09 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  42.22 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  44.89 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  42.22 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  43.81 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  44.89 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  42.22 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  41.96 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  43.5 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  43.24 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  40.6 
 
 		 258 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  40.43 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  43.84 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  40.62 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  39.48 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  38.05 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  37.44 
 
 		 243 aa  141  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  39.11 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  37.28 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  36 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  36.44 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  38.67 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  36.79 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  33.94 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  32.87 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  32.8 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  30.41 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  29.91 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  33.16 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  31.7 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  40.16 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  31.49 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  26.32 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0453  hypothetical protein  32.23 
 
 		 828 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  32.8 
 
 		 1078 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4224  hypothetical protein  29.03 
 
 		 821 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.965892 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  32.8 
 
 		 1078 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1079 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  25.98 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  24.41 
 
 		 283 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>