More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1937 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  100 
 
 		 246 aa  494  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  91.46 
 
 		 246 aa  461  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  90.24 
 
 		 246 aa  462  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  92.28 
 
 		 246 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  61.34 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  59.75 
 
 		 242 aa  298  4e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  57.98 
 
 		 245 aa  291  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  53.07 
 
 		 244 aa  265  5e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  55.17 
 
 		 245 aa  261  8e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  53.02 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  48.91 
 
 		 245 aa  228  9e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  46.19 
 
 		 501 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  45.87 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  32.52 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  28.5 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  34.45 
 
 		 239 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  34.45 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  33.19 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0719  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.2 
 
 		 752 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000106259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.58 
 
 		 705 aa  98.2  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0790  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.18 
 
 		 703 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1438  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31 
 
 		 708 aa  97.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  32.37 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1612  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.77 
 
 		 699 aa  97.1  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.322426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31 
 
 		 708 aa  97.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0201008  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  33.2 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1950  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.16 
 
 		 740 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.139447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  31.95 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.51 
 
 		 693 aa  95.9  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  32.77 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1656  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.17 
 
 		 736 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  33.47 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  30.83 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  31.3 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  33.75 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  32.85 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  34.15 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  33.61 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  33.19 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  33.48 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0151  ribonuclease PH  34.39 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  30.42 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0488  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.38 
 
 		 732 aa  92.8  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3479  ribonuclease PH  31.67 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1442  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  30.38 
 
 		 735 aa  92.4  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  32.08 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  34.39 
 
 		 288 aa  92.4  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  30.96 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  31.82 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  31.82 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  31.62 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.3 
 
 		 747 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000737281  hitchhiker  0.00038852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  33.03 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  30.49 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  32.22 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0041  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.58 
 
 		 716 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.382985  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.49 
 
 		 777 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0953  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.51 
 
 		 735 aa  90.1  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0472  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.09 
 
 		 718 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0212673  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  30.54 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1269  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.09 
 
 		 719 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.124632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  30.96 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  30.96 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1390  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.09 
 
 		 719 aa  89.4  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  32.13 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  30.28 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  31.98 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  30.83 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3232  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.98 
 
 		 761 aa  88.6  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.555601 
 
 
-
 
NC_002620  TC0230  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.58 
 
 		 693 aa  87.8  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.336814  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1167  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  30.26 
 
 		 698 aa  88.2  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0773  ribonuclease PH  33.48 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3180  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  30.4 
 
 		 746 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.846647 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  34.3 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  30.24 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  30.25 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  31.3 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_002936  DET0970  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.89 
 
 		 720 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.28 
 
 		 701 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_843  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  31.22 
 
 		 720 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.946894  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0193  ribonuclease PH  34.07 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  28.63 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2745  ribonuclease PH  30 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0325  ribonuclease PH  31.39 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  31.8 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  30.99 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.67 
 
 		 712 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  33 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  33.5 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  33 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0569  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.32 
 
 		 695 aa  86.7  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30 
 
 		 700 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>