280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1198 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1198  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
491 aa  966    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.135202  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  53.55 
 
 
507 aa  437  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  26.44 
 
 
831 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  36.22 
 
 
725 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  32.14 
 
 
788 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  34.13 
 
 
763 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  27.73 
 
 
810 aa  72  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  30.43 
 
 
720 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  35.34 
 
 
644 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  26.69 
 
 
744 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  32.79 
 
 
914 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  34.18 
 
 
771 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  27.78 
 
 
800 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 
790 aa  67.4  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  27.75 
 
 
812 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 
790 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  29.82 
 
 
782 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.33 
 
 
859 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  29.66 
 
 
886 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  31.43 
 
 
795 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  25.56 
 
 
846 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  27.03 
 
 
634 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  34.81 
 
 
730 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  27.37 
 
 
676 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  30.67 
 
 
762 aa  64.3  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  34.75 
 
 
689 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  35.04 
 
 
800 aa  63.9  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  27.92 
 
 
754 aa  63.5  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  34.45 
 
 
641 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  27.75 
 
 
689 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  31.54 
 
 
760 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  34.21 
 
 
649 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  33.58 
 
 
635 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  28.47 
 
 
790 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  44.3 
 
 
706 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  38.54 
 
 
669 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  41.98 
 
 
673 aa  62  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  39.08 
 
 
739 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.58 
 
 
783 aa  61.6  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  39.08 
 
 
734 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  32.21 
 
 
685 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  29.09 
 
 
862 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  29.44 
 
 
749 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  28.74 
 
 
715 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  34.71 
 
 
681 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  28.74 
 
 
709 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  31.93 
 
 
672 aa  62  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  39.08 
 
 
734 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  39.08 
 
 
739 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  29.5 
 
 
890 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  25.34 
 
 
662 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  36 
 
 
827 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  45.07 
 
 
698 aa  61.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  30.1 
 
 
850 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  28.31 
 
 
815 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  32.76 
 
 
820 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  31.93 
 
 
825 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  37.93 
 
 
707 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  28.41 
 
 
639 aa  60.1  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  32.08 
 
 
732 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  25.09 
 
 
667 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  33.74 
 
 
943 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 
715 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 
715 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  30.08 
 
 
662 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  24.91 
 
 
680 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  28.79 
 
 
876 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  32.42 
 
 
706 aa  58.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  36 
 
 
692 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  30.94 
 
 
677 aa  57.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  42.68 
 
 
684 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  29.37 
 
 
1305 aa  57.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  26.6 
 
 
748 aa  57.4  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  42.17 
 
 
688 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  33.78 
 
 
689 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  35.85 
 
 
681 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  25.34 
 
 
662 aa  57.4  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2553  transglutaminase-like superfamily protein  29.74 
 
 
1169 aa  57.4  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  27.48 
 
 
673 aa  57.4  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  31.79 
 
 
726 aa  57  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  28.05 
 
 
742 aa  57  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  29.89 
 
 
645 aa  57  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  28.05 
 
 
742 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  28.05 
 
 
742 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4926  transglutaminase-like superfamily domain protein  32.61 
 
 
1092 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  28.05 
 
 
742 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0588  transglutaminase-like  32.61 
 
 
1092 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.332727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  36.78 
 
 
674 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  38.55 
 
 
705 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 
822 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  43.94 
 
 
282 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  25.59 
 
 
774 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  35.82 
 
 
668 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  30.61 
 
 
806 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  31.82 
 
 
685 aa  55.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0954  transglutaminase-like domain-containing protein  32.53 
 
 
1173 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2614  transglutaminase domain-containing protein  32.53 
 
 
1107 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.95635 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 
685 aa  55.1  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  37.5 
 
 
671 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  35.9 
 
 
668 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>