More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0954 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3608  transglutaminase domain protein  62.34 
 
 		 1104 aa  1366    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  0.238952 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2614  transglutaminase domain-containing protein  99.28 
 
 		 1107 aa  2223    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.95635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4926  transglutaminase-like superfamily domain protein  57.7 
 
 		 1092 aa  1251    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3334  transglutaminase domain protein  50.49 
 
 		 1139 aa  1048    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387126  normal  0.0234354 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1778  transglutaminase domain-containing protein  55.65 
 
 		 1140 aa  1230    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0770  transglutaminase domain-containing protein  55.65 
 
 		 1140 aa  1230    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0588  transglutaminase-like  58.3 
 
 		 1092 aa  1257    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.332727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  57.83 
 
 		 1118 aa  1253    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2637  transglutaminase domain-containing protein  62.32 
 
 		 1091 aa  1335    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0330314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3010  transglutaminase-like  55.39 
 
 		 1117 aa  1229    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.424161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3412  transglutaminase domain-containing protein  55.67 
 
 		 1137 aa  1234    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0067  transglutaminase-like  54.23 
 
 		 1147 aa  1200    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4758  transglutaminase domain-containing protein  62.98 
 
 		 1125 aa  1335    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446948  normal  0.0794526 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1063  transglutaminase domain-containing protein  55.65 
 
 		 1140 aa  1229    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2524  transglutaminase domain protein  53.69 
 
 		 1120 aa  1149    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2055  transglutaminase-like superfamily protein  55.57 
 
 		 1140 aa  1228    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4406  transglutaminase domain protein  54.11 
 
 		 1157 aa  1211    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0541  transglutaminase-like  59.39 
 
 		 1091 aa  1276    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.649463  normal  0.642878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1014  transglutaminase domain protein  54.88 
 
 		 1128 aa  1181    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5075  transglutaminase domain-containing protein  64.71 
 
 		 1080 aa  1427    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804608  normal  0.120829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0210  transglutaminase domain protein  64.48 
 
 		 1122 aa  1415    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0954  transglutaminase-like domain-containing protein  100 
 
 		 1173 aa  2370    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4110  transglutaminase domain-containing protein  55.24 
 
 		 1148 aa  1228    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1933  transglutaminase-like  54.73 
 
 		 1142 aa  1220    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3343  transglutaminase domain protein  72.61 
 
 		 1108 aa  1638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2470  transglutaminase domain-containing protein  66.25 
 
 		 1122 aa  1468    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3405  transglutaminase domain protein  53.47 
 
 		 1180 aa  1212    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2558  transglutaminase-like  56.94 
 
 		 1090 aa  1238    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.884999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3752  hypothetical protein  70.79 
 
 		 1114 aa  1612    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1919  transglutaminase domain-containing protein  55.42 
 
 		 1145 aa  1235    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1712  transglutaminase-like  64.24 
 
 		 1114 aa  1456    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.347512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0515  transglutaminase domain-containing protein  62.18 
 
 		 1136 aa  1351    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1309  Protein of unknown function DUF2126  52.83 
 
 		 1100 aa  1151    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.544002  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2246  transglutaminase domain protein  52.88 
 
 		 1145 aa  1124    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.637206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4489  transglutaminase domain-containing protein  53.81 
 
 		 1142 aa  1202    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3099  transglutaminase-like domain-containing protein  52.59 
 
 		 1116 aa  1176    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.595628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1701  transglutaminase-like  63.62 
 
 		 1090 aa  1397    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126756  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0655  transglutaminase domain-containing protein  58.99 
 
 		 1097 aa  1218    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.559922  hitchhiker  0.000135984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4275  transglutaminase domain protein  64.93 
 
 		 1113 aa  1441    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0684346  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2038  transglutaminase domain-containing protein  55.65 
 
 		 1140 aa  1229    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.654776  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0769  transglutaminase domain-containing protein  55.57 
 
 		 1140 aa  1228    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106544  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1621  transglutaminase domain-containing protein  62.91 
 
 		 1091 aa  1334    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0187167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0725  transglutaminase family protein  53.54 
 
 		 1157 aa  1168    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3879  transglutaminase domain protein  55.17 
 
 		 1158 aa  1195    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2605  transglutaminase domain-containing protein  53.32 
 
 		 1174 aa  1200    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0988  transglutaminase domain-containing protein  49.96 
 
 		 1119 aa  1114    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3585  transglutaminase-like  64.3 
 
 		 1128 aa  1456    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.222679  normal  0.726735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3512  transglutaminase domain protein  51.18 
 
 		 1141 aa  1169    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0857  transglutaminase domain protein  75.92 
 
 		 1112 aa  1666    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250645  normal  0.314962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5370  transglutaminase domain protein  65.1 
 
 		 1081 aa  1432    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3017  transglutaminase domain-containing protein  91.76 
 
 		 1127 aa  2014    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0756013  normal  0.525776 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4255  transglutaminase-like  55.85 
 
 		 1137 aa  1234    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2320  transglutaminase-like protein  49.56 
 
 		 1108 aa  979    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0950324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3724  transglutaminase domain protein  62.78 
 
 		 1116 aa  1394    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.565418  normal  0.0894015 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1392  transglutaminase-like enzyme, cysteine protease  51.58 
 
 		 1151 aa  1169    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.284441  normal  0.67203 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3522  transglutaminase domain-containing protein  55.04 
 
 		 1149 aa  1231    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2947  hypothetical protein  64.83 
 
 		 1103 aa  1424    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2359  transglutaminase domain-containing protein  49.47 
 
 		 1108 aa  977    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4111  transglutaminase domain-containing protein  55.85 
 
 		 1137 aa  1234    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2051  Protein of unknown function DUF2126  46.7 
 
 		 1078 aa  912    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.238647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0393  transglutaminase domain-containing protein  52.84 
 
 		 1114 aa  1147    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2907  transglutaminase-like domain protein  53.69 
 
 		 1120 aa  1149    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3415  transglutaminase domain-containing protein  62.78 
 
 		 1116 aa  1394    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2367  transglutaminase domain-containing protein  49.56 
 
 		 1108 aa  979    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12586  hypothetical protein  48.81 
 
 		 1140 aa  995    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1218  transglutaminase domain-containing protein  53.54 
 
 		 1135 aa  1199    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.695465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2628  transglutaminase domain-containing protein  49.82 
 
 		 1112 aa  988    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4005  transglutaminase domain-containing protein  55.46 
 
 		 1144 aa  1238    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962784  normal  0.211891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3033  transglutaminase domain-containing protein  55.64 
 
 		 1100 aa  1232    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2315  Protein of unknown function DUF2126  46.82 
 
 		 1155 aa  970    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3771  transglutaminase domain-containing protein  48.65 
 
 		 1133 aa  986    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510583  normal  0.20356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1065  transglutaminase domain-containing protein  54.97 
 
 		 1121 aa  1176    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417532 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0678  transglutaminase domain-containing protein  55.57 
 
 		 1140 aa  1229    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3645  transglutaminase domain protein  72.25 
 
 		 1108 aa  1634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1496  transglutaminase domain protein  59.76 
 
 		 1188 aa  629  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2553  transglutaminase-like superfamily protein  54.64 
 
 		 1169 aa  632  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3159  transglutaminase-like  52.64 
 
 		 1217 aa  624  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.668757  normal  0.863803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1477  hypothetical protein  39.11 
 
 		 731 aa  462  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.288638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4657  transglutaminase domain protein  47.72 
 
 		 289 aa  266  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0892  transglutaminase domain protein  43.71 
 
 		 277 aa  207  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5163  transglutaminase domain protein  40.07 
 
 		 279 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2052  Protein of unknown function DUF2126  34.95 
 
 		 697 aa  184  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.598866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4490  transglutaminase domain protein  33.94 
 
 		 296 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4426  transglutaminase domain protein  33.94 
 
 		 296 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1611  transglutaminase domain protein  34.95 
 
 		 305 aa  140  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3591  transglutaminase domain protein  32.66 
 
 		 291 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  36.5 
 
 		 313 aa  133  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4766  transglutaminase domain protein  31.11 
 
 		 290 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1555  transglutaminase domain-containing protein  34.47 
 
 		 290 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  33.81 
 
 		 291 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  34.44 
 
 		 276 aa  131  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  33.57 
 
 		 300 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 		 290 aa  129  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  32.03 
 
 		 297 aa  129  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  31.67 
 
 		 290 aa  128  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2984  transglutaminase domain protein  33.09 
 
 		 302 aa  128  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1034  transglutaminase-like  34.19 
 
 		 287 aa  127  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2753  transglutaminase-like  35.02 
 
 		 288 aa  127  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4755  transglutaminase domain protein  31.25 
 
 		 302 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0273  transglutaminase domain-containing protein  31.75 
 
 		 328 aa  123  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.260289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>