More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2553 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2553  transglutaminase-like superfamily protein  100 
 
 		 1169 aa  2388    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0515  transglutaminase domain-containing protein  56.51 
 
 		 1136 aa  1270    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4926  transglutaminase-like superfamily domain protein  62.23 
 
 		 1092 aa  750    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4406  transglutaminase domain protein  69.71 
 
 		 1157 aa  1680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298511 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0678  transglutaminase domain-containing protein  71.59 
 
 		 1140 aa  1717    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1778  transglutaminase domain-containing protein  71.5 
 
 		 1140 aa  1716    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0988  transglutaminase domain-containing protein  53.62 
 
 		 1119 aa  641    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0588  transglutaminase-like  62.23 
 
 		 1092 aa  752    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.332727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5370  transglutaminase domain protein  62.48 
 
 		 1081 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4110  transglutaminase domain-containing protein  71.54 
 
 		 1148 aa  1708    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3010  transglutaminase-like  63.93 
 
 		 1117 aa  1511    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.424161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3879  transglutaminase domain protein  63.99 
 
 		 1158 aa  1497    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0067  transglutaminase-like  69.7 
 
 		 1147 aa  1623    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1496  transglutaminase domain protein  56.17 
 
 		 1188 aa  1353    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2055  transglutaminase-like superfamily protein  71.67 
 
 		 1140 aa  1721    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0541  transglutaminase-like  61.95 
 
 		 1091 aa  738    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.649463  normal  0.642878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3415  transglutaminase domain-containing protein  53.5 
 
 		 1116 aa  1227    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0655  transglutaminase domain-containing protein  63.32 
 
 		 1097 aa  1429    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.559922  hitchhiker  0.000135984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3405  transglutaminase domain protein  70.11 
 
 		 1180 aa  1688    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1933  transglutaminase-like  72.45 
 
 		 1142 aa  1749    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2038  transglutaminase domain-containing protein  71.59 
 
 		 1140 aa  1718    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.654776  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0770  transglutaminase domain-containing protein  71.5 
 
 		 1140 aa  1716    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2470  transglutaminase domain-containing protein  54.81 
 
 		 1122 aa  1249    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2558  transglutaminase-like  58.93 
 
 		 1090 aa  690    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.884999  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1309  Protein of unknown function DUF2126  62.72 
 
 		 1100 aa  662    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.544002  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1919  transglutaminase domain-containing protein  71.65 
 
 		 1145 aa  1701    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3343  transglutaminase domain protein  55.04 
 
 		 1108 aa  1254    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1712  transglutaminase-like  62.77 
 
 		 1114 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.347512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4005  transglutaminase domain-containing protein  71.59 
 
 		 1144 aa  1729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962784  normal  0.211891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0210  transglutaminase domain protein  52.43 
 
 		 1122 aa  638    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2524  transglutaminase domain protein  54.83 
 
 		 1120 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3099  transglutaminase-like domain-containing protein  57.4 
 
 		 1116 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.595628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1701  transglutaminase-like  56.58 
 
 		 1090 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126756  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1218  transglutaminase domain-containing protein  65.85 
 
 		 1135 aa  1611    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.695465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0857  transglutaminase domain protein  55 
 
 		 1112 aa  1218    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250645  normal  0.314962 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1063  transglutaminase domain-containing protein  71.59 
 
 		 1140 aa  1718    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3159  transglutaminase-like  69.96 
 
 		 1217 aa  1747    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.668757  normal  0.863803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  62.2 
 
 		 1118 aa  1457    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0725  transglutaminase family protein  69.19 
 
 		 1157 aa  1650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2637  transglutaminase domain-containing protein  56.5 
 
 		 1091 aa  645    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0330314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1014  transglutaminase domain protein  61.77 
 
 		 1128 aa  662    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3585  transglutaminase-like  54.45 
 
 		 1128 aa  1275    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.222679  normal  0.726735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3645  transglutaminase domain protein  64.23 
 
 		 1108 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3752  hypothetical protein  53.46 
 
 		 1114 aa  1229    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2907  transglutaminase-like domain protein  54.83 
 
 		 1120 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2246  transglutaminase domain protein  54.18 
 
 		 1145 aa  1229    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.637206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4255  transglutaminase-like  73.63 
 
 		 1137 aa  1762    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253349  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2605  transglutaminase domain-containing protein  72.5 
 
 		 1174 aa  1748    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3522  transglutaminase domain-containing protein  71.63 
 
 		 1149 aa  1727    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3724  transglutaminase domain protein  53.67 
 
 		 1116 aa  1230    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.565418  normal  0.0894015 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4489  transglutaminase domain-containing protein  69.66 
 
 		 1142 aa  1677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3412  transglutaminase domain-containing protein  73.72 
 
 		 1137 aa  1765    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4111  transglutaminase domain-containing protein  73.63 
 
 		 1137 aa  1762    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4275  transglutaminase domain protein  55.14 
 
 		 1113 aa  1255    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0684346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0393  transglutaminase domain-containing protein  52.33 
 
 		 1114 aa  1209    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3512  transglutaminase domain protein  52.81 
 
 		 1141 aa  1235    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5075  transglutaminase domain-containing protein  62.97 
 
 		 1080 aa  659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804608  normal  0.120829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3608  transglutaminase domain protein  54.16 
 
 		 1104 aa  1238    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  0.238952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3033  transglutaminase domain-containing protein  60.1 
 
 		 1100 aa  1418    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2947  hypothetical protein  56.94 
 
 		 1103 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1065  transglutaminase domain-containing protein  55.19 
 
 		 1121 aa  1237    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417532 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0769  transglutaminase domain-containing protein  71.67 
 
 		 1140 aa  1721    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106544  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1392  transglutaminase-like enzyme, cysteine protease  58.88 
 
 		 1151 aa  633  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.284441  normal  0.67203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1621  transglutaminase domain-containing protein  61.78 
 
 		 1091 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0187167 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0954  transglutaminase-like domain-containing protein  54.64 
 
 		 1173 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3017  transglutaminase domain-containing protein  54.92 
 
 		 1127 aa  612  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0756013  normal  0.525776 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2614  transglutaminase domain-containing protein  62.77 
 
 		 1107 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.95635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4758  transglutaminase domain-containing protein  61.07 
 
 		 1125 aa  590  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446948  normal  0.0794526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3334  transglutaminase domain protein  57.69 
 
 		 1139 aa  586  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387126  normal  0.0234354 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12586  hypothetical protein  50.09 
 
 		 1140 aa  542  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2315  Protein of unknown function DUF2126  54.99 
 
 		 1155 aa  538  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3771  transglutaminase domain-containing protein  51.25 
 
 		 1133 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510583  normal  0.20356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2628  transglutaminase domain-containing protein  50.54 
 
 		 1112 aa  531  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2320  transglutaminase-like protein  51.06 
 
 		 1108 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0950324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2367  transglutaminase domain-containing protein  51.06 
 
 		 1108 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2359  transglutaminase domain-containing protein  51.74 
 
 		 1108 aa  526  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2051  Protein of unknown function DUF2126  51.79 
 
 		 1078 aa  507  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.238647 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1477  hypothetical protein  44.14 
 
 		 731 aa  386  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.288638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4657  transglutaminase domain protein  53.12 
 
 		 289 aa  324  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0892  transglutaminase domain protein  44.25 
 
 		 277 aa  238  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5163  transglutaminase domain protein  42.11 
 
 		 279 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2052  Protein of unknown function DUF2126  34.05 
 
 		 697 aa  196  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.598866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4426  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 		 296 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4490  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 		 296 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  37.64 
 
 		 291 aa  163  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  37.86 
 
 		 300 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1611  transglutaminase domain protein  32.79 
 
 		 305 aa  151  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2984  transglutaminase domain protein  35.11 
 
 		 302 aa  149  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  36.43 
 
 		 313 aa  149  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  33.9 
 
 		 297 aa  148  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3591  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 		 291 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  33.21 
 
 		 290 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  34.8 
 
 		 276 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  32.53 
 
 		 290 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4755  transglutaminase domain protein  34.29 
 
 		 302 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1408  transglutaminase domain protein  36.68 
 
 		 302 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.543659 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1034  transglutaminase-like  35.64 
 
 		 287 aa  142  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1814  transglutaminase domain protein  33.57 
 
 		 302 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.853279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2469  transglutaminase domain-containing protein  32.51 
 
 		 313 aa  141  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.451679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3978  transglutaminase-like  34.66 
 
 		 304 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>