More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1904 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  54.5 
 
 
668 aa  761    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  50.37 
 
 
660 aa  673    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  50.66 
 
 
691 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  48.82 
 
 
695 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  50.07 
 
 
691 aa  675    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  48.14 
 
 
664 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  52.46 
 
 
666 aa  694    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  52.46 
 
 
666 aa  694    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  48.02 
 
 
661 aa  644    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  49.55 
 
 
676 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  52.64 
 
 
688 aa  737    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  50.6 
 
 
662 aa  690    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  50.52 
 
 
670 aa  671    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  53.98 
 
 
672 aa  704    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  47.99 
 
 
664 aa  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  53.45 
 
 
666 aa  765    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  69.72 
 
 
668 aa  1006    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  48.44 
 
 
661 aa  642    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  49.48 
 
 
670 aa  658    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  53.15 
 
 
666 aa  762    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  47.58 
 
 
674 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  53.6 
 
 
666 aa  764    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  48.29 
 
 
664 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  53.45 
 
 
666 aa  765    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  49.63 
 
 
669 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  48.2 
 
 
664 aa  645    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  53.45 
 
 
666 aa  764    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  53.45 
 
 
680 aa  768    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  50.75 
 
 
698 aa  684    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  48.14 
 
 
664 aa  646    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  52.31 
 
 
666 aa  694    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  51.97 
 
 
674 aa  684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  49.85 
 
 
669 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5186  transketolase  48.38 
 
 
697 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2422  transketolase  47.3 
 
 
695 aa  642    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.635984 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  49.03 
 
 
670 aa  656    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  53.45 
 
 
666 aa  764    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  51.12 
 
 
668 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  50.22 
 
 
670 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  53.3 
 
 
666 aa  754    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  48.58 
 
 
664 aa  652    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  51.27 
 
 
670 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  50.45 
 
 
664 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  55.11 
 
 
668 aa  778    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  58.83 
 
 
684 aa  828    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  50.82 
 
 
669 aa  663    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  51.12 
 
 
669 aa  668    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  53.45 
 
 
666 aa  764    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  50.15 
 
 
686 aa  689    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  47.58 
 
 
674 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  53.6 
 
 
666 aa  764    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  49.18 
 
 
668 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  50.3 
 
 
668 aa  654    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  50.68 
 
 
659 aa  682    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  49.93 
 
 
707 aa  669    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  47.99 
 
 
668 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  55.17 
 
 
671 aa  743    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  51.27 
 
 
670 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  48.88 
 
 
668 aa  660    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  49.41 
 
 
699 aa  675    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  52.2 
 
 
678 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  50.23 
 
 
662 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2874  transketolase  49.26 
 
 
687 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  48.1 
 
 
694 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  100 
 
 
668 aa  1381    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  48.14 
 
 
664 aa  642    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  54.8 
 
 
681 aa  733    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  49.7 
 
 
691 aa  659    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  52.32 
 
 
662 aa  716    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  52.99 
 
 
667 aa  723    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  55.64 
 
 
682 aa  739    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  52.18 
 
 
697 aa  741    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  49.33 
 
 
667 aa  642    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  54.71 
 
 
653 aa  718    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  49.71 
 
 
691 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  49.85 
 
 
691 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2974  transketolase  46.79 
 
 
697 aa  641    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  53.45 
 
 
680 aa  764    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  50.82 
 
 
672 aa  669    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  50.29 
 
 
695 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  51.71 
 
 
666 aa  687    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  51.25 
 
 
711 aa  723    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  50.68 
 
 
659 aa  684    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4964  transketolase  49.85 
 
 
691 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.102617 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  49.85 
 
 
658 aa  655    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  50.23 
 
 
662 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  48.81 
 
 
658 aa  642    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  47.96 
 
 
694 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  53.98 
 
 
665 aa  746    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  49.71 
 
 
691 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  49.25 
 
 
655 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2214  transketolase  47.51 
 
 
708 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00287199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  48.8 
 
 
692 aa  677    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  48.18 
 
 
660 aa  646    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  63.77 
 
 
671 aa  906    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  52.65 
 
 
711 aa  731    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  49.55 
 
 
676 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  49.63 
 
 
675 aa  664    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  48.73 
 
 
668 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  50.52 
 
 
669 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>