260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3724 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  63.91 
 
 
318 aa  300  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  62.88 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  54.34 
 
 
302 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  52.77 
 
 
301 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.62 
 
 
300 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.62 
 
 
313 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  53.76 
 
 
298 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  58.55 
 
 
255 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  50.74 
 
 
300 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  50.74 
 
 
300 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  50.37 
 
 
300 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  53.58 
 
 
512 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  52.96 
 
 
343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  52.96 
 
 
343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  56.18 
 
 
304 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  50.56 
 
 
306 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  48.53 
 
 
299 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.72 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.34 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  49.63 
 
 
300 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  50.74 
 
 
300 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  49.26 
 
 
300 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  50.76 
 
 
307 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  50.76 
 
 
307 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  52.71 
 
 
299 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  50.39 
 
 
298 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.56 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  53.79 
 
 
308 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.19 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  53.91 
 
 
299 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  51.7 
 
 
298 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  46.15 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  42.44 
 
 
307 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.78 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  39.78 
 
 
306 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  36.76 
 
 
312 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  29.18 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.66 
 
 
312 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.66 
 
 
313 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 
307 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  28.91 
 
 
302 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  28.91 
 
 
302 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30.08 
 
 
300 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  29.41 
 
 
289 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  28.91 
 
 
300 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.52 
 
 
302 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  28.52 
 
 
300 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  38.04 
 
 
315 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  29.18 
 
 
307 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  31.73 
 
 
316 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  32.37 
 
 
293 aa  95.1  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  29.62 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  28.12 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.09 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  24.4 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  29.91 
 
 
397 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  28.64 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  28.19 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.71 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.44 
 
 
292 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 
311 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  28.51 
 
 
402 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2851  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17163 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3175  hypothetical protein  33.52 
 
 
299 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  30.65 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  25.1 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  30.68 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  32.7 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  29.78 
 
 
309 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  27.88 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.9 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  26.81 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  25.19 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  26.64 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  26.64 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  29.28 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  26.82 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  32.95 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  32.95 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  27.23 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 
293 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  29.28 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  29.28 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.51 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2716  hypothetical protein  29.44 
 
 
329 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  25.39 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3068  hypothetical protein  30.47 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  26.34 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  39.78 
 
 
310 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  39.78 
 
 
310 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  26.37 
 
 
293 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  25.76 
 
 
328 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  39.78 
 
 
310 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  39.78 
 
 
310 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  39.78 
 
 
310 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  27.1 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>