More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2348 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  92.71 
 
 		 439 aa  727    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 439 aa  853    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  94.76 
 
 		 439 aa  763    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  98.86 
 
 		 439 aa  845    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  71.92 
 
 		 439 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  70.78 
 
 		 439 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  73.23 
 
 		 437 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  65.98 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.45 
 
 		 437 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  64.98 
 
 		 445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  61.1 
 
 		 440 aa  474  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  35.65 
 
 		 442 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  40.84 
 
 		 437 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 441 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  34.96 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  35.2 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 442 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  34.68 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 445 aa  229  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 441 aa  227  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 444 aa  220  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 458 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 462 aa  200  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000685276  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0356  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0244  histidine kinase  33.63 
 
 		 438 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 441 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  31.47 
 
 		 444 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0311  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 458 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  35.54 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  32.28 
 
 		 449 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 465 aa  186  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0240  ATPase domain-containing protein  33.18 
 
 		 438 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000252659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 463 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 484 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0241  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 438 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 438 aa  179  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4488  sensor histidine kinase  31.59 
 
 		 438 aa  177  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1914  histidine kinase  42.07 
 
 		 451 aa  176  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  34.74 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000059891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  33.6 
 
 		 456 aa  170  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 454 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  34.21 
 
 		 448 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 454 aa  169  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  37.79 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  33.11 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  33.85 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 454 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 454 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  36.32 
 
 		 482 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  36.1 
 
 		 454 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  36.26 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  36.26 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  30.43 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  36.26 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 471 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  36.73 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  39.55 
 
 		 429 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  30.43 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 458 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 456 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  32.99 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  31.35 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  36.05 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  31.09 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  35.69 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>