More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78097 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_78097  monovalent cation:H+ antiporter, CPA1 family (NHX1)  100 
 
 		 653 aa  1328    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.147084  normal  0.966822 
 
 
-
 
NC_006686  CND04380  monovalent inorganic cation transporter, putative  50.08 
 
 		 698 aa  547  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02288  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  61.61 
 
 		 703 aa  542  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22353  predicted protein  31.44 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14403  phospholipase  33.08 
 
 		 359 aa  189  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990038  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2316  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  33.77 
 
 		 357 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967211  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1764  predicted protein  33.5 
 
 		 389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289242  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1871  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  30.87 
 
 		 427 aa  170  8e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43552  predicted protein  25.36 
 
 		 971 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774573  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43052  predicted protein  27.53 
 
 		 704 aa  144  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  24.95 
 
 		 521 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  22.63 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  22.63 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 		 531 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  24.59 
 
 		 520 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  28.08 
 
 		 399 aa  98.2  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 		 705 aa  97.8  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  25.29 
 
 		 527 aa  90.5  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  23.88 
 
 		 536 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  24.88 
 
 		 531 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  21.51 
 
 		 1247 aa  85.9  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  24.53 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  26.19 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  24.53 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  24.26 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  23.18 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  23.18 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  23.18 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 		 420 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  25.84 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  23.73 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  21.46 
 
 		 538 aa  80.1  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  29.28 
 
 		 422 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 		 680 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  23.24 
 
 		 526 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  24.67 
 
 		 692 aa  79  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  24.67 
 
 		 692 aa  79  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  26.97 
 
 		 682 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  22.86 
 
 		 566 aa  78.2  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  22.98 
 
 		 526 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  22.98 
 
 		 526 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  22.98 
 
 		 526 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  22.98 
 
 		 526 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  22.98 
 
 		 526 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  25.28 
 
 		 535 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  24.65 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  24.66 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  26.02 
 
 		 533 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  24.05 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  25.54 
 
 		 528 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  23.51 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  23.71 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  24.72 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  24.72 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  26.71 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  22.29 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  22.72 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  26.49 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  24.08 
 
 		 564 aa  73.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2583  sodium/hydrogen exchanger  26.43 
 
 		 568 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  22.61 
 
 		 526 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  25.67 
 
 		 552 aa  73.6  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  22.06 
 
 		 425 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  24.29 
 
 		 624 aa  73.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  23.02 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  25.14 
 
 		 424 aa  72  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  25 
 
 		 537 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  24.23 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  24.28 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  22.31 
 
 		 526 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  24.66 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  24.54 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  23.38 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  23.39 
 
 		 698 aa  70.5  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  24.5 
 
 		 832 aa  70.5  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  24.42 
 
 		 418 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  22.55 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  25.77 
 
 		 621 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  25.88 
 
 		 812 aa  70.1  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  24.62 
 
 		 548 aa  69.7  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  20.11 
 
 		 526 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  21.25 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  20.92 
 
 		 528 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  26.39 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  24.81 
 
 		 556 aa  68.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  23.98 
 
 		 705 aa  68.6  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  24.26 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  24.93 
 
 		 832 aa  68.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  24.93 
 
 		 832 aa  68.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  25.77 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  23.98 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  20.64 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  23.2 
 
 		 549 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  20.66 
 
 		 526 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  22.67 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  23.2 
 
 		 549 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>