149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65933 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_65933  predicted protein  100 
 
 
1468 aa  3057    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.70896  normal  0.0114479 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08701  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02410)  37.48 
 
 
1462 aa  304  7.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01460  vacuolar membrane protein, putative  33.69 
 
 
1073 aa  238  8e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02861  F-box and WD40 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11870)  31.71 
 
 
656 aa  66.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.714475 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04226  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (SOF1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06290)  28.48 
 
 
447 aa  65.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31512  predicted protein  27.63 
 
 
538 aa  63.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268234  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.03 
 
 
1411 aa  61.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.45 
 
 
1557 aa  61.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.79 
 
 
1831 aa  60.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  31.11 
 
 
484 aa  58.9  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  22.64 
 
 
1289 aa  58.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.49 
 
 
1364 aa  58.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.53 
 
 
1236 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43057  predicted protein  28.08 
 
 
1315 aa  58.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.94 
 
 
1599 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.36 
 
 
676 aa  57  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 
1878 aa  56.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.64 
 
 
1217 aa  56.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.2 
 
 
1652 aa  55.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.08 
 
 
930 aa  56.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46969  predicted protein  26.51 
 
 
660 aa  55.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.83 
 
 
1196 aa  55.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00310  rRNA processing protein Pwp1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02630)  22.75 
 
 
535 aa  54.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.584247  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00570  transcription factor, putative  28.46 
 
 
550 aa  55.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.69 
 
 
1686 aa  55.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  23.7 
 
 
367 aa  54.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29180  predicted protein  29.14 
 
 
505 aa  54.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.648326  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.92 
 
 
1807 aa  53.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  29.29 
 
 
1661 aa  54.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  25.62 
 
 
307 aa  54.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82025  predicted protein  28.77 
 
 
460 aa  54.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.830676 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  24.32 
 
 
466 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.15 
 
 
1357 aa  53.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.61 
 
 
1208 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  21.35 
 
 
1443 aa  53.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.78 
 
 
1330 aa  53.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.17 
 
 
932 aa  53.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  28.95 
 
 
1229 aa  52.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  24.87 
 
 
1097 aa  52.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.46 
 
 
1262 aa  52.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43990  predicted protein  27.27 
 
 
313 aa  52.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.160926  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  26.39 
 
 
1016 aa  52.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  26.39 
 
 
1016 aa  52.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.55 
 
 
740 aa  52  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.53 
 
 
833 aa  52  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.77 
 
 
1684 aa  52  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.95 
 
 
1221 aa  52  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.35 
 
 
1789 aa  52  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77338  predicted protein  24.55 
 
 
922 aa  52  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98376  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.74 
 
 
675 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  23.87 
 
 
1211 aa  51.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  24.55 
 
 
344 aa  51.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.06 
 
 
1481 aa  51.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.4 
 
 
1267 aa  51.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.8 
 
 
947 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.42 
 
 
1760 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  21.37 
 
 
335 aa  50.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.84 
 
 
1901 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.33 
 
 
898 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.32 
 
 
1868 aa  50.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  26.51 
 
 
522 aa  50.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  25.14 
 
 
432 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.81 
 
 
924 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  25.17 
 
 
1401 aa  50.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 
1311 aa  50.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07530  57.7 kda trp-asp repeats containing protein, putative  27.56 
 
 
523 aa  50.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  23.66 
 
 
1176 aa  50.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  28.7 
 
 
1399 aa  50.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.81 
 
 
1188 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.17 
 
 
1193 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8842  predicted protein  27.08 
 
 
379 aa  50.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  22.74 
 
 
1163 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.4 
 
 
792 aa  50.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3069  predicted protein  27.21 
 
 
409 aa  50.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00421566  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  24.69 
 
 
617 aa  49.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.33 
 
 
1363 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  21.86 
 
 
696 aa  49.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.24 
 
 
565 aa  49.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.03 
 
 
1474 aa  49.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.78 
 
 
1161 aa  49.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.78 
 
 
1161 aa  49.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  24.07 
 
 
1344 aa  48.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.54 
 
 
1609 aa  48.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  24.72 
 
 
813 aa  48.9  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.78 
 
 
677 aa  48.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.79 
 
 
1188 aa  48.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.21 
 
 
1626 aa  48.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.27 
 
 
737 aa  48.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  24.39 
 
 
317 aa  48.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23077  predicted protein  23.5 
 
 
379 aa  48.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  25.53 
 
 
901 aa  48.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.29 
 
 
642 aa  48.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05972  Coatomer subunit beta', putative (Eurofung)  21.21 
 
 
853 aa  48.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.296123 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  21.47 
 
 
418 aa  48.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  26.28 
 
 
1279 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  21.57 
 
 
1190 aa  48.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.21 
 
 
1858 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.1 
 
 
1553 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  23.79 
 
 
826 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  26.28 
 
 
1279 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>