More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54533 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  100 
 
 		 350 aa  719    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  59.29 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  58.31 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  56.53 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  49.84 
 
 		 658 aa  307  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  52.09 
 
 		 323 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  46.67 
 
 		 358 aa  276  6e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  44.87 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  43.91 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  43.91 
 
 		 333 aa  263  4.999999999999999e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  43.91 
 
 		 330 aa  259  7e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  41.46 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  42.15 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  43.79 
 
 		 358 aa  248  9e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  41.23 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  42.81 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  40.69 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  40.51 
 
 		 325 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  41.9 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  39.44 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  39.44 
 
 		 322 aa  229  7e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  39.44 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  41.46 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  40.18 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  39.75 
 
 		 322 aa  227  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  40.32 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  39.56 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  37.61 
 
 		 407 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  41.59 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  40.06 
 
 		 322 aa  215  9e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  37.87 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  37.83 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  39.62 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  36.45 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  35.03 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  36.14 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  41.88 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  31 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 312 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  29.32 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  28.62 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  28.41 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  34.3 
 
 		 235 aa  99.8  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  33.8 
 
 		 235 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  34.43 
 
 		 227 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  31.42 
 
 		 225 aa  96.7  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  30.47 
 
 		 243 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  30.54 
 
 		 227 aa  92.8  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  30.29 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  34.47 
 
 		 224 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  30.58 
 
 		 363 aa  87.8  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  32.18 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  31.4 
 
 		 235 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  34.78 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  29.26 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  32 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  29.08 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  34.25 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  27.98 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  26.87 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  25 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  24.49 
 
 		 215 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  28.57 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  30.45 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  24.62 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0296  recA protein  26.67 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.197187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0804  recA protein  28.64 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  28.78 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  26.18 
 
 		 541 aa  63.5  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  29.19 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  32.23 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  28.64 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  29.33 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  24.49 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  27.13 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  29.05 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  27.13 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  26.32 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  28.23 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  27.01 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2398  recA protein  26.94 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.38659e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3557  recA protein  28.23 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0551  recombinase A  27.39 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.99148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  26.87 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  31.25 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  28.23 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  27.27 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  29.19 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  28.5 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  29.47 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  26.79 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  28.5 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  28.5 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  28.23 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  26.79 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1372  recombinase A  25.38 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  27.88 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  28.9 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1392  recombinase A  25.96 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>