More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1343 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 492 aa  1007    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  50.47 
 
 		 231 aa  213  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0013  beta-lactamase domain protein  42.06 
 
 		 253 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.173708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  47.81 
 
 		 238 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  40.08 
 
 		 254 aa  206  7e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2442  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 		 254 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  49.33 
 
 		 231 aa  204  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  48.61 
 
 		 259 aa  203  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  45 
 
 		 270 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  47.2 
 
 		 244 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  40.71 
 
 		 253 aa  199  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  50.74 
 
 		 232 aa  199  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  50.24 
 
 		 240 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09578  hydrolase, metal-dependent  40.32 
 
 		 253 aa  195  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.513248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  51.21 
 
 		 245 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 		 254 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  41.27 
 
 		 254 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  48.5 
 
 		 233 aa  189  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  42.52 
 
 		 255 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  40.87 
 
 		 252 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  36.72 
 
 		 252 aa  179  9e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 		 257 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  43.87 
 
 		 228 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  38.49 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  37.35 
 
 		 252 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  39.76 
 
 		 264 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  39.53 
 
 		 251 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0280  metallo-beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 253 aa  171  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000676724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  42.59 
 
 		 251 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  39.77 
 
 		 255 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  41.12 
 
 		 228 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  42.72 
 
 		 221 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2290  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 		 255 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466086  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  39.29 
 
 		 232 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0150  beta-lactamase domain protein  37.01 
 
 		 253 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  39.68 
 
 		 286 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  36.08 
 
 		 253 aa  164  4.0000000000000004e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  36.72 
 
 		 252 aa  163  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  36.72 
 
 		 252 aa  163  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  43.26 
 
 		 224 aa  163  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  35.91 
 
 		 260 aa  160  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  39.68 
 
 		 251 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  39.09 
 
 		 235 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  39.92 
 
 		 253 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 251 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  41.74 
 
 		 237 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 		 251 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  39.45 
 
 		 230 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 207 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  39.44 
 
 		 228 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  43.41 
 
 		 236 aa  150  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  40.28 
 
 		 247 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 221 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 209 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  39.05 
 
 		 213 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 213 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 214 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 240 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 227 aa  146  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 232 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  40.2 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  36.8 
 
 		 259 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  39.63 
 
 		 213 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  42.02 
 
 		 227 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0997  hypothetical protein  32.58 
 
 		 272 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 213 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  37.17 
 
 		 237 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2683  putative hydrolase  35.91 
 
 		 266 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0964  hypothetical protein  32.58 
 
 		 272 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  37.09 
 
 		 228 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2081  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  36.47 
 
 		 265 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  36.47 
 
 		 265 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  39.35 
 
 		 218 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  38.31 
 
 		 247 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 218 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  39.72 
 
 		 212 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 235 aa  140  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 239 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  37.84 
 
 		 213 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40.29 
 
 		 211 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1532  metal-dependent hydrolase  33.71 
 
 		 265 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2006  hypothetical protein  33.96 
 
 		 267 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3118  hypothetical protein  35.5 
 
 		 267 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  39.23 
 
 		 239 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  42.78 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1585  beta-lactamase-like  32.95 
 
 		 272 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  42.02 
 
 		 221 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  42.78 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  36.71 
 
 		 214 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  40.32 
 
 		 202 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0554  beta-lactamase domain-containing protein  34.6 
 
 		 265 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  42.56 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  41.26 
 
 		 221 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 227 aa  137  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  38.99 
 
 		 236 aa  136  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  34.68 
 
 		 252 aa  136  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  34.23 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  34.6 
 
 		 266 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  39.05 
 
 		 232 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>